More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2458 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  601  1e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  601  1e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  99.33 
 
 
299 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 
299 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  99.33 
 
 
299 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  99.33 
 
 
299 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  99.33 
 
 
299 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  94.98 
 
 
299 aa  574  1e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  57.72 
 
 
301 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1031  LysR family transcriptional regulator  57.72 
 
 
302 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4422  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 
302 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.481788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2524  transcriptional regulator, LysR family  58.33 
 
 
320 aa  355  6e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1391  LysR family transcriptional regulator  56.71 
 
 
302 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4333  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 
302 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3099  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 
309 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71594  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0056  putative transcriptional regulator  57.38 
 
 
306 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00680  LysR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
306 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1021  LysR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
302 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3252  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  54.55 
 
 
302 aa  332  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  5.63268e-08 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0969  LysR family substrate binding transcriptional regulator  54.55 
 
 
302 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1323  transcriptional regulator, LysR family  56.9 
 
 
300 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3839  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
302 aa  327  1e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0458  transcriptional regulator, LysR family  55.37 
 
 
309 aa  327  2e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.512377  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1387  transcriptional regulator, LysR family  56.57 
 
 
300 aa  327  2e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0754648  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3627  transcriptional regulator, LysR family  52.68 
 
 
305 aa  316  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3488  transcriptional regulator, LysR family  52.67 
 
 
302 aa  313  3e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1091  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
307 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2219  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  53.61 
 
 
317 aa  305  5e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1157  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
307 aa  304  1e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1091  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
307 aa  303  2e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.93926 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3473  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
307 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2447  transcriptional regulator, LysR family  55.33 
 
 
294 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.707294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2349  transcriptional regulator, LysR family  49.16 
 
 
302 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1207  transcriptional regulator, LysR family  48.06 
 
 
314 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3163  LysR family transcriptional regulator  48.06 
 
 
314 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1807  LysR family transcriptional regulator  53.18 
 
 
305 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.625247  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3307  LysR family transcriptional regulator  48.06 
 
 
314 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3164  LysR family transcriptional regulator  48.06 
 
 
314 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2782  LysR family transcriptional regulator  48.22 
 
 
320 aa  283  2e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0196765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1852  transcriptional regulator, LysR family  48.8 
 
 
296 aa  274  1e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.387981  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1264  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  45.12 
 
 
335 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8728  transcriptional regulator, LysR family  52.23 
 
 
304 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  41.33 
 
 
307 aa  243  4e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2042  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 
297 aa  239  3e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.579809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
299 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  40.67 
 
 
302 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000935  LysR-family transcriptional regulator  40.89 
 
 
295 aa  235  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0375861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 
303 aa  234  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
306 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
307 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
303 aa  225  6e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0186  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
307 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
296 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 
335 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.46 
 
 
299 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
298 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
303 aa  221  1e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
298 aa  221  2e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  39.74 
 
 
303 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
298 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
322 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
313 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  39.67 
 
 
309 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6395  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
306 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 
298 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  3.18758e-05 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3037  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
299 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.585683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0776  transcriptional regulator, LysR family protein  39 
 
 
299 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
298 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 
293 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5522  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
306 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0758082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5143  transcriptional regulator, LysR family  42.95 
 
 
305 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5886  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
306 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437235  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3222  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
302 aa  214  1e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.8 
 
 
305 aa  214  1e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 
313 aa  214  2e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
309 aa  213  3e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0611  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 
300 aa  213  4e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
295 aa  212  5e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
302 aa  212  6e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
298 aa  211  8e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2792  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.73 
 
 
295 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 
306 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0823  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
301 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3512  transcriptional regulator  38.59 
 
 
300 aa  208  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  41.95 
 
 
306 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0606  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
300 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3630  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 
300 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
310 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3303  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
298 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2893  LysR, substrate-binding  37.58 
 
 
298 aa  205  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3812  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
300 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
322 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 
312 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3688  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
300 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3342  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
300 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 
305 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 
312 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.2 
 
 
304 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3332  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
307 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0789426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>