More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0054 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1840  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.43 
 
 		 349 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0267  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  99.43 
 
 		 349 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2712  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.43 
 
 		 349 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3287  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.14 
 
 		 349 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0054  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 349 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0055  ABC transporter, permease protein  99.71 
 
 		 349 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0047  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  97.13 
 
 		 349 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4453  inner-membrane translocator  58.31 
 
 		 345 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57987  hitchhiker  0.00971028 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1175  branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.55 
 
 		 570 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.139317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1078  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 		 570 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0441127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2539  ABC transporter-like protein  33.21 
 
 		 559 aa  123  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.119506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 562 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  27.98 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 335 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7509  branched chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 580 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  28.71 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.71 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  25.47 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  27 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  30 
 
 		 648 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  27.19 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  27.22 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.22 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.01 
 
 		 646 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  31.13 
 
 		 606 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2752  inner-membrane translocator  25.95 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  26.61 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.35 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  31.28 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  28.1 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  28.08 
 
 		 646 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  27.38 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.29 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.41 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  26.95 
 
 		 643 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  27.31 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  26.85 
 
 		 643 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.61 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2252  inner-membrane translocator  25.15 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  28.44 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.32 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  26.33 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  33.16 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  28.51 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0474  inner-membrane translocator  25.67 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  27.53 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  27.62 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  28.36 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.78 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  23.65 
 
 		 571 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  28.53 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>