118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0035 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  99.25 
 
 
165 aa  278  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  277  5e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  85.07 
 
 
134 aa  244  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  61.07 
 
 
139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  59.7 
 
 
136 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  57.46 
 
 
134 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  58.96 
 
 
136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  50.75 
 
 
147 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  47.76 
 
 
137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  48.84 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  51.28 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  45.04 
 
 
143 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  48.41 
 
 
138 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 
140 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  42.75 
 
 
143 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  44.03 
 
 
209 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  44.27 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  42.19 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  44.8 
 
 
144 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  41.41 
 
 
139 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 
139 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  42.54 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  41.41 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  43.51 
 
 
374 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  43.85 
 
 
138 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
139 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  41.22 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  42.75 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  45.04 
 
 
141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  42.06 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  41.98 
 
 
165 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  37.4 
 
 
147 aa  105  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  39.57 
 
 
141 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  43.51 
 
 
141 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  41.91 
 
 
147 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  38.93 
 
 
159 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  45.19 
 
 
111 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  38.17 
 
 
142 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  45.37 
 
 
147 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  43.52 
 
 
143 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
143 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  39.02 
 
 
144 aa  96.7  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  36.8 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  34.35 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  31.2 
 
 
143 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  34.51 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  36.03 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  31.93 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
163 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  33.63 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  28.57 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  30.91 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  33.33 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  29.66 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  28.16 
 
 
122 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  40.3 
 
 
147 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  28.44 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  32.32 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  31.91 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  26.32 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  29.89 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  34.44 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  31.82 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  48.94 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  28.71 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  34.18 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  32.97 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  29.41 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  29.76 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  28.83 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  29.21 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  28.72 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  28.57 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  29.07 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  38.89 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  38.89 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  38.89 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>