More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2480 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  100 
 
 
194 aa  377  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  93.81 
 
 
194 aa  354  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  91.24 
 
 
194 aa  347  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  91.75 
 
 
194 aa  345  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  91.75 
 
 
194 aa  345  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  91.75 
 
 
194 aa  345  3e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  91.75 
 
 
194 aa  345  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  90.72 
 
 
194 aa  340  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  89.69 
 
 
194 aa  339  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.58 
 
 
195 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2755  neutral amino-acid efflux protein  37.43 
 
 
195 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0462537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2857  neutral amino-acid efflux protein  37.43 
 
 
195 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.719199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2839  neutral amino-acid efflux protein  37.43 
 
 
195 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2861  neutral amino-acid efflux protein  37.43 
 
 
195 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2973  neutral amino-acid efflux protein  37.43 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2731  neutral amino-acid efflux protein  36.36 
 
 
195 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0764776  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1090  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 
195 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0625608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2958  neutral amino-acid efflux protein  36.36 
 
 
195 aa  124  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2735  neutral amino-acid efflux protein  36.36 
 
 
195 aa  124  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00799309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1099  neutral amino-acid efflux protein  36.36 
 
 
195 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0442418  normal  0.231568 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2865  neutral amino-acid efflux protein  35.83 
 
 
195 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02472  neutral amino-acid efflux system  35.83 
 
 
195 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02436  hypothetical protein  35.83 
 
 
195 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3815  neutral amino-acid efflux protein  35.83 
 
 
195 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.799014  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  31.72 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  29.44 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  29.44 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 
199 aa  95.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  31.91 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4234  hypothetical protein  31.79 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744826  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.77 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  30.85 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 
198 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  32.93 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  32.29 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  29.95 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  27.32 
 
 
225 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  29.79 
 
 
209 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  31.28 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.22 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  31.15 
 
 
640 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.69 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  34.08 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  28.34 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  34.08 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  31.89 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  34.08 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  25.52 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  25.91 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.09 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  27.37 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.52 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1102  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  33.51 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  31.15 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  31.15 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  27.57 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  31.15 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  31.15 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  28.65 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  31.15 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3541  hypothetical protein  28.09 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000708449 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  31.15 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  23.67 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  30.81 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.65 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  26.94 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  27.08 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  30.41 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>