285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2416 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  100 
 
 		 517 aa  1017    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  52.14 
 
 		 518 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  51.75 
 
 		 517 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  55.99 
 
 		 522 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  53.31 
 
 		 517 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  54.53 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  51.08 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  47.57 
 
 		 515 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  50.78 
 
 		 519 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  47.56 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  47.39 
 
 		 519 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  49.7 
 
 		 515 aa  463  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  43.84 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  43.16 
 
 		 538 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  46.35 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  42.28 
 
 		 523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  46.26 
 
 		 516 aa  401  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  48.13 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  49.41 
 
 		 521 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  46.89 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  46.35 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  39.64 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  40.5 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  40.31 
 
 		 522 aa  359  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  42.45 
 
 		 999 aa  350  4e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  40.11 
 
 		 983 aa  345  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  37.97 
 
 		 994 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  36.08 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  34.49 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  35.6 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  28.54 
 
 		 570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  32.02 
 
 		 642 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  27.08 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  30.65 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  32.27 
 
 		 658 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  30.81 
 
 		 645 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  30.5 
 
 		 636 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  32.94 
 
 		 644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  30.3 
 
 		 671 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  32.23 
 
 		 668 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  27.55 
 
 		 572 aa  127  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  31.18 
 
 		 638 aa  127  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  32.78 
 
 		 667 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  31.25 
 
 		 643 aa  126  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  31.04 
 
 		 701 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  27 
 
 		 560 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  34.04 
 
 		 675 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  34.04 
 
 		 675 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.03 
 
 		 712 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  31.27 
 
 		 557 aa  117  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  28.88 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  27.6 
 
 		 641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  28.21 
 
 		 560 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.63 
 
 		 682 aa  113  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  29.63 
 
 		 564 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  31.03 
 
 		 679 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  27.84 
 
 		 579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.13 
 
 		 676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.33 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  30.33 
 
 		 680 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  29.46 
 
 		 557 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.07 
 
 		 676 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  31.03 
 
 		 715 aa  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.67 
 
 		 690 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.79 
 
 		 694 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  30.92 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  28.57 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.68 
 
 		 692 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.67 
 
 		 690 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  28.14 
 
 		 583 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.12 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  28.57 
 
 		 681 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.59 
 
 		 685 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.01 
 
 		 687 aa  100  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  28.53 
 
 		 715 aa  100  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  26.32 
 
 		 559 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  24.69 
 
 		 546 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.39 
 
 		 690 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.65 
 
 		 674 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.35 
 
 		 679 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  27.44 
 
 		 559 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  31.83 
 
 		 570 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0472  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.18 
 
 		 687 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.72 
 
 		 765 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11390  acetophenone carboxylase  25.92 
 
 		 711 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.67 
 
 		 692 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1833  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.85 
 
 		 731 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.26 
 
 		 680 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.68 
 
 		 693 aa  94.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144893 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  27.58 
 
 		 682 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  29 
 
 		 686 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.92 
 
 		 690 aa  94  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.94 
 
 		 658 aa  94  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.04 
 
 		 684 aa  93.6  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1449  acetone carboxylase beta subunit  25.64 
 
 		 712 aa  93.6  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  24.42 
 
 		 708 aa  93.6  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  31.14 
 
 		 735 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.41 
 
 		 683 aa  93.2  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.94 
 
 		 690 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1163  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.74 
 
 		 711 aa  93.2  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>