120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4369 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  74.43 
 
 		 462 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  858    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  75.11 
 
 		 462 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  61.87 
 
 		 455 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  69.48 
 
 		 463 aa  561  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  61.64 
 
 		 493 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  46.99 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 466 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  38.14 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  38.01 
 
 		 435 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 492 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  34.47 
 
 		 435 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  34.24 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 456 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  36.32 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  35.94 
 
 		 424 aa  229  8e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 469 aa  226  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 456 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 456 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  31.95 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 467 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  30.4 
 
 		 449 aa  169  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 472 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 419 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  30.2 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  26.9 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.93 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  25.93 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  28.72 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 		 443 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  26.54 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  26.83 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  26.86 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  26.32 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  26.32 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  26.32 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  26.32 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  26.09 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  28.44 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 450 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  25.18 
 
 		 408 aa  109  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  26.86 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  23.88 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  27.77 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  24.03 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  24.34 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 430 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 465 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  25.6 
 
 		 451 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  25.39 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  23.75 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  23.39 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 444 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  22.51 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  24.56 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  28.41 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>