223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4205 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 97 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  76.09 
 
 		 116 aa  147  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  64.37 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  63.44 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  63.44 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  65.59 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  64.44 
 
 		 99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  66.67 
 
 		 98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  57.73 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  58.06 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  53.61 
 
 		 100 aa  100  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  53.76 
 
 		 98 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  53.76 
 
 		 98 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  52.75 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  52.08 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  53.85 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  48.39 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  46.32 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  43.01 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  43.01 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  48.39 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  40.86 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  39.18 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  41.94 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  40.86 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  40.43 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  38.14 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  40.21 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  36.17 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  40.43 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  38.14 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  38.14 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  43.01 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  38.14 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  37.11 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  39.58 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9610  predicted protein  37.5 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  36.08 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  36.08 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  36.08 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  36.08 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>