More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3356 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  100 
 
 
358 aa  724    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  76.75 
 
 
357 aa  554  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  74.58 
 
 
357 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  72.55 
 
 
357 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  72.83 
 
 
357 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  71.51 
 
 
364 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.06 
 
 
355 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.99 
 
 
356 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.94 
 
 
354 aa  379  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.99 
 
 
358 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.35 
 
 
356 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.7 
 
 
355 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.28 
 
 
355 aa  359  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.98 
 
 
356 aa  359  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.28 
 
 
355 aa  358  7e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.26 
 
 
355 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
355 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.14 
 
 
358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 
357 aa  351  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.6 
 
 
357 aa  350  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.44 
 
 
355 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.29 
 
 
376 aa  345  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 
355 aa  341  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.21 
 
 
355 aa  341  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  48.46 
 
 
355 aa  336  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  46.93 
 
 
355 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.11 
 
 
359 aa  331  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.69 
 
 
357 aa  323  4e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.83 
 
 
349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.17 
 
 
355 aa  298  7e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.94 
 
 
357 aa  295  6e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.33 
 
 
358 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.13 
 
 
354 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.58 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.62 
 
 
355 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.9 
 
 
353 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.97 
 
 
344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.56 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.57 
 
 
397 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.21 
 
 
396 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
365 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.4 
 
 
296 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.28 
 
 
296 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.92 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.92 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.92 
 
 
289 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.26 
 
 
294 aa  177  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
295 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0064  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.92 
 
 
304 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
297 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
297 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
297 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.76 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.76 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4164  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.5 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1783  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.66 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2035  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.5 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.25 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.17 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.92 
 
 
296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
293 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0210  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
301 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375545  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  40.25 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.92 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
297 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
297 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.6 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.33 
 
 
405 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
297 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
295 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.45 
 
 
301 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.5 
 
 
292 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3013  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 
296 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  hitchhiker  0.00164401 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36 
 
 
400 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1283  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.59 
 
 
295 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  39.83 
 
 
292 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.64 
 
 
320 aa  170  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1450  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.75 
 
 
306 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.13 
 
 
299 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
312 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
294 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  36.57 
 
 
400 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 
295 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494959  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.89 
 
 
290 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2629  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
298 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.357597  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02720  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 
307 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
293 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1491  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
290 aa  169  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.27 
 
 
293 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0626  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
294 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.353924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.49 
 
 
292 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
297 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
297 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3848  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
296 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.14 
 
 
291 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.91 
 
 
293 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>