More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0210 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0210  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
301 aa  613  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375545  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  73.33 
 
 
291 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  71.93 
 
 
291 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.02 
 
 
289 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  64.91 
 
 
289 aa  384  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
292 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.28 
 
 
293 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.12 
 
 
298 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.83 
 
 
292 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.83 
 
 
289 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.83 
 
 
289 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.31 
 
 
289 aa  380  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 
291 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
292 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
292 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
290 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
291 aa  376  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.77 
 
 
298 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.29 
 
 
305 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
294 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.51 
 
 
292 aa  371  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1563  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 
289 aa  372  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
294 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.92 
 
 
294 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
294 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
294 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.27 
 
 
292 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.84 
 
 
297 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  60.9 
 
 
304 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.08 
 
 
295 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0048  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.03 
 
 
294 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.231271  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.46 
 
 
292 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.08 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 
292 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.38 
 
 
297 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
293 aa  367  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.25 
 
 
287 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.77 
 
 
297 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
286 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.7 
 
 
289 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.35 
 
 
298 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 
297 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.08 
 
 
297 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  59.45 
 
 
295 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
293 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 
297 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.93 
 
 
292 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.25 
 
 
290 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
289 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0416  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  62.5 
 
 
292 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.08 
 
 
312 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3075  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.11788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.41 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.77 
 
 
292 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.32 
 
 
305 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.41 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 
293 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.9 
 
 
287 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4721  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.25 
 
 
302 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
292 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.42 
 
 
291 aa  364  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1919  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.52 
 
 
298 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.06 
 
 
286 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  63.64 
 
 
270 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  63.73 
 
 
292 aa  363  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1760  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.18 
 
 
298 aa  364  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0453677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.35 
 
 
289 aa  363  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3052  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
298 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.664934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
307 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3464  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.66 
 
 
293 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4180  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
293 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.112992  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.52 
 
 
293 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
293 aa  363  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.390759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.2 
 
 
300 aa  362  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
297 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.99 
 
 
294 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.35 
 
 
293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.99 
 
 
297 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2240  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
305 aa  361  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 
296 aa  361  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1073  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
296 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
296 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  61.92 
 
 
293 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
296 aa  361  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.21 
 
 
296 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.93 
 
 
358 aa  360  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.34957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.92 
 
 
293 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6654  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.65 
 
 
292 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
294 aa  360  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.64 
 
 
289 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1473  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.65 
 
 
287 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.905305  normal  0.376761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2896  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 
288 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.257197 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.35 
 
 
291 aa  359  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000315653  normal  0.563962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.92 
 
 
293 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0399407 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.92 
 
 
293 aa  359  4e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.57 
 
 
296 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0434  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.64 
 
 
287 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.824963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.57 
 
 
291 aa  358  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.43 
 
 
296 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0279  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.79 
 
 
309 aa  358  6e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.643202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>