158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4010 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  902    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  55.8 
 
 
462 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  50.34 
 
 
437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  50.46 
 
 
448 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  53.04 
 
 
427 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  54.4 
 
 
421 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  53.18 
 
 
430 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  55.69 
 
 
423 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  52.27 
 
 
418 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  52.14 
 
 
421 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.76 
 
 
417 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  52.36 
 
 
424 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  47.84 
 
 
413 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  45.23 
 
 
446 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.07 
 
 
429 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  48.69 
 
 
418 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 
441 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  33.03 
 
 
438 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  32.19 
 
 
434 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  33.72 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  33.86 
 
 
437 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  31.78 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  32.13 
 
 
473 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  33.48 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  33.03 
 
 
452 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  29.66 
 
 
435 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  29.47 
 
 
428 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  30.16 
 
 
433 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  29.45 
 
 
439 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  26.65 
 
 
412 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  30.38 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  27.89 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  30.79 
 
 
437 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  30.13 
 
 
447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  27.65 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  28.11 
 
 
469 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  27.64 
 
 
445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  28.5 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  25.69 
 
 
423 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  29.95 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  30.06 
 
 
475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  26.71 
 
 
415 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  25.9 
 
 
434 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.83 
 
 
445 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  25.68 
 
 
438 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  25.4 
 
 
437 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  25.62 
 
 
437 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26.26 
 
 
415 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  26.8 
 
 
432 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  24.49 
 
 
437 aa  123  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  26.06 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  25.8 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  29.89 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
437 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  25.23 
 
 
437 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  25.23 
 
 
437 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  26.82 
 
 
439 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 
437 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
437 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  27 
 
 
424 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.11 
 
 
478 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 
409 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  36.22 
 
 
460 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  36.08 
 
 
442 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  36.08 
 
 
464 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  26.85 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  36.31 
 
 
574 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  27.5 
 
 
556 aa  96.3  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  27.19 
 
 
466 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  36.7 
 
 
452 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  29.28 
 
 
411 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  31.25 
 
 
572 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 
504 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  31.84 
 
 
486 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  28.88 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  28.28 
 
 
761 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  28.7 
 
 
558 aa  68.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  33.6 
 
 
376 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.18 
 
 
490 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  32.22 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.04 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.55 
 
 
454 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  25.16 
 
 
475 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  26.13 
 
 
468 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  24.34 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 
436 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.83 
 
 
468 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  24.83 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.34 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.83 
 
 
475 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.16 
 
 
478 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.16 
 
 
471 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  27.21 
 
 
425 aa  55.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  23.49 
 
 
478 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  25.24 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.32 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  24.16 
 
 
478 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 
472 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  23.81 
 
 
478 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  30.48 
 
 
473 aa  53.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>