117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2308 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  100 
 
 
167 aa  337  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  74.15 
 
 
165 aa  226  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
181 aa  142  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  52.56 
 
 
165 aa  137  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 
335 aa  134  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  45.75 
 
 
484 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  49.36 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  50.35 
 
 
156 aa  124  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  49.31 
 
 
305 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  46.31 
 
 
287 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
291 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  42.48 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  43.79 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
176 aa  108  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
174 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
174 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
174 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 
179 aa  104  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 
180 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  40.28 
 
 
299 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 
153 aa  94.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 
170 aa  89  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 
231 aa  54.7  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  30.19 
 
 
317 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  42.62 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  34.33 
 
 
126 aa  48.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
195 aa  47.8  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
234 aa  47.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  38.57 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  38.57 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  32.32 
 
 
317 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01490  conserved hypothetical protein  37.65 
 
 
199 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
151 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  42.62 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  25.93 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.45 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  26.27 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  46 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  31.03 
 
 
314 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
235 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  42.62 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  42.62 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  42.62 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  42.62 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  42.62 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  42.62 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  32.58 
 
 
314 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
204 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  32.58 
 
 
314 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
203 aa  44.3  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
206 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
211 aa  44.3  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
239 aa  44.3  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  39.22 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  28.85 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  32.58 
 
 
314 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  32.58 
 
 
314 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  36.36 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
254 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  40.91 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  25.93 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  39.22 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  27.2 
 
 
319 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  34.09 
 
 
315 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46543  predicted protein  36.36 
 
 
532 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  38.2 
 
 
269 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  39.22 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
237 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  34.26 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  29.51 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
303 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 
229 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  39.22 
 
 
129 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  22.05 
 
 
148 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
140 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  33.64 
 
 
197 aa  41.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  36.36 
 
 
134 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  25.19 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
225 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
220 aa  41.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  28.44 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>