148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0360 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 736 aa  1516    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.37 
 
 		 716 aa  661    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.96 
 
 		 706 aa  746    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.27 
 
 		 698 aa  685    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.01 
 
 		 768 aa  276  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.4 
 
 		 772 aa  266  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  27.25 
 
 		 764 aa  249  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  28.06 
 
 		 778 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  27.19 
 
 		 777 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 778 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  27.47 
 
 		 777 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  27.5 
 
 		 762 aa  241  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  27.6 
 
 		 785 aa  223  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  27.82 
 
 		 702 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  31.34 
 
 		 780 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  24.01 
 
 		 703 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  33.79 
 
 		 768 aa  180  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  27.26 
 
 		 689 aa  180  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  26.82 
 
 		 706 aa  178  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  26.35 
 
 		 706 aa  178  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  26.72 
 
 		 691 aa  178  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  24.6 
 
 		 760 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  27.22 
 
 		 691 aa  177  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  27.05 
 
 		 689 aa  177  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  26.98 
 
 		 689 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  26.98 
 
 		 689 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  26.58 
 
 		 691 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.33 
 
 		 776 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.33 
 
 		 777 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  26.55 
 
 		 689 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  33.33 
 
 		 776 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  33.33 
 
 		 776 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  33.33 
 
 		 776 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.01 
 
 		 689 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  26.12 
 
 		 689 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  40.1 
 
 		 787 aa  161  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.84 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.46 
 
 		 763 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  37.95 
 
 		 702 aa  153  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  35.65 
 
 		 755 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  33.48 
 
 		 753 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  35.58 
 
 		 748 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  34.12 
 
 		 712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.53 
 
 		 741 aa  114  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  33.33 
 
 		 799 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  35.48 
 
 		 829 aa  111  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.04 
 
 		 672 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  33.02 
 
 		 759 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.15 
 
 		 659 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.14 
 
 		 757 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  36.07 
 
 		 734 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.33 
 
 		 691 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.93 
 
 		 766 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  24.17 
 
 		 666 aa  104  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  31.36 
 
 		 771 aa  104  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  37.93 
 
 		 742 aa  104  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.33 
 
 		 685 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.26 
 
 		 732 aa  103  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.64 
 
 		 767 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  36.84 
 
 		 742 aa  102  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.74 
 
 		 733 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  29.55 
 
 		 269 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  29.43 
 
 		 706 aa  102  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.14 
 
 		 813 aa  100  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  24.66 
 
 		 727 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  35.39 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  33.93 
 
 		 726 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  36.26 
 
 		 726 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.27 
 
 		 724 aa  99.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.06 
 
 		 746 aa  98.6  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.93 
 
 		 758 aa  98.2  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  25.29 
 
 		 852 aa  97.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  30 
 
 		 705 aa  97.8  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  37.5 
 
 		 735 aa  97.4  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  36.93 
 
 		 724 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  36.93 
 
 		 724 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  36.11 
 
 		 724 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  31.75 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.52 
 
 		 705 aa  96.3  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  33.33 
 
 		 759 aa  95.5  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.57 
 
 		 747 aa  95.9  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  32.5 
 
 		 717 aa  95.5  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.38 
 
 		 788 aa  95.5  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  31.94 
 
 		 761 aa  94  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.73 
 
 		 695 aa  94  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.86 
 
 		 645 aa  93.6  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  33.71 
 
 		 758 aa  93.2  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.6 
 
 		 832 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  33.5 
 
 		 902 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.91 
 
 		 804 aa  92  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  32.2 
 
 		 684 aa  91.3  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  35.45 
 
 		 706 aa  91.3  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.74 
 
 		 786 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.06 
 
 		 670 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  29.08 
 
 		 679 aa  90.5  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.5 
 
 		 693 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  31.79 
 
 		 680 aa  89  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.14 
 
 		 748 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  34.86 
 
 		 795 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  31.21 
 
 		 695 aa  87.8  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>