More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0030 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0030  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03430  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  62.59 
 
 		 287 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.176993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2994  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  62.46 
 
 		 293 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26290  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  60.9 
 
 		 295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0675  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  61.59 
 
 		 290 aa  353  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000369862  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1956  phosphomethylpyrimidine kinase  37.55 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2742  pyridoxamine kinase  38.43 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2201  pyridoxamine kinase  36.96 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2811  pyridoxamine kinase  34.93 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2653  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.87 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1011  pyridoxamine kinase  34.43 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000463881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0901  pyridoxamine kinase  33.33 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04110  pyridoxamine kinase  32.55 
 
 		 290 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1948  pyridoxamine kinase  31.88 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.49187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2618  pyridoxamine kinase  31.76 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3710  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.82 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0417661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2304  pyridoxamine kinase  31.37 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000939996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2757  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.82 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000026444  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0796  pyridoxal kinase  31.7 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.887672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0738  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  30.42 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0428  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase-like protein  30.08 
 
 		 250 aa  94  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  29.39 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  30.83 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  30.83 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  30.83 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  30.83 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  30.83 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  30.83 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  30.83 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  30.83 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  30.45 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  28.63 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  30.74 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  30.35 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  30.35 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  30.35 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  30.35 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  27.56 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  28.52 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  27.44 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  27.56 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  30 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  30.15 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  26.86 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  26.86 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  29.39 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  26.75 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  29.88 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  26.88 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  29.5 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  26.88 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  27.21 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  25.88 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  27.27 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  27.91 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  28.63 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  27.24 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  25.52 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  26.47 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  25.42 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  25.97 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  27.14 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  34.2 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  27.96 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  25.71 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  27.95 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  27.69 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  27.24 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  26.82 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  26.04 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  26.04 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  26.71 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  27.97 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  32.14 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  29.67 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  34.27 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  24.91 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  25.35 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  27.42 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  28.4 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  26.91 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  29.67 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  27.56 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  26.32 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  25.76 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  29.2 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  26.46 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  24.89 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  31.63 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  26.64 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.3 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  30.46 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  25.36 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  28.23 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  27.24 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  26.39 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  28.17 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  28.11 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  26.4 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  27.66 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>