106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0738 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0738  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  100 
 
 		 275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2653  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.63 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2304  pyridoxamine kinase  37.55 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000939996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2618  pyridoxamine kinase  38.58 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1011  pyridoxamine kinase  40 
 
 		 290 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000463881  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1956  phosphomethylpyrimidine kinase  34.85 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0901  pyridoxamine kinase  35.83 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2201  pyridoxamine kinase  34.52 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04110  pyridoxamine kinase  34.21 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1948  pyridoxamine kinase  32.03 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.49187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2811  pyridoxamine kinase  33.2 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2742  pyridoxamine kinase  32.94 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03430  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  32.28 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.176993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2757  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  32.16 
 
 		 271 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000026444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0030  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  30.42 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2994  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.15 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0675  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  31.08 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000369862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3710  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.92 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0417661  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26290  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  32.03 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0796  pyridoxal kinase  27.42 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.887672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0428  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase-like protein  25.69 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.17 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  27.78 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  27.78 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  27.14 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  27.04 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  27.04 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  27.04 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  27.04 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  27.78 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  27.04 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  25.97 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  26.26 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  29.17 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  29.68 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  28.92 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  27.11 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  27.71 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  28.48 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  26.18 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  27.71 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  27.71 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  27.71 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  27.71 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  26.98 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0646  phosphomethylpyrimidine kinase  26.27 
 
 		 445 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0762615  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  27.47 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  27.71 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  28.24 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  25.2 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  27.93 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  28.49 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  27.11 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  24.7 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2928  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  25.24 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  27.87 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31981  protein involved in bud site selection  22.93 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.294425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  26.2 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  25.1 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  26.7 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  26.2 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  25.83 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  24.51 
 
 		 334 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  26.2 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  26.2 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  27.52 
 
 		 288 aa  45.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1368  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  30.53 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  24.85 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  27.6 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  27.6 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  27.6 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  27.6 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0096  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  28.92 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  26.37 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  27.6 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  27.6 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  27.08 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  27.27 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  27.08 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  28.73 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  26.55 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  26.55 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  26.6 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  27.08 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  30.72 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  27.44 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  25.45 
 
 		 599 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  25.7 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0011  phosphomethylpyrimidine kinase superfamily protein  25.1 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0542  phosphomethylpyrimidine kinase  26.76 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  25.53 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  27.08 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  27.08 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  26.2 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  27.08 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  31.1 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2592  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  28.07 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  25.17 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>