294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2618 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2618  pyridoxamine kinase  100 
 
 
280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2304  pyridoxamine kinase  95.71 
 
 
280 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000939996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04110  pyridoxamine kinase  45.82 
 
 
290 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0901  pyridoxamine kinase  44.16 
 
 
293 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1948  pyridoxamine kinase  45 
 
 
294 aa  255  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.49187  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1011  pyridoxamine kinase  44.36 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000463881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2742  pyridoxamine kinase  44.2 
 
 
300 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2201  pyridoxamine kinase  42.75 
 
 
303 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2811  pyridoxamine kinase  43.96 
 
 
297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1956  phosphomethylpyrimidine kinase  38.97 
 
 
272 aa  189  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2653  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.3 
 
 
284 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2757  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.55 
 
 
271 aa  170  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000026444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3710  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  34.41 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0417661  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0796  pyridoxal kinase  38.01 
 
 
264 aa  157  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.887672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0738  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  38.58 
 
 
275 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001675 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03430  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  31.77 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.176993 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0030  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.76 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0675  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  30.82 
 
 
290 aa  142  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000369862  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2994  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  30.22 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26290  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  30.66 
 
 
295 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0428  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase-like protein  30.26 
 
 
250 aa  113  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  25.21 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  27.38 
 
 
282 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  25.28 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  25.1 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  24.91 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  26.86 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  24.53 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  24.53 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  24.53 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  24.53 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  26.94 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  24.53 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  24.91 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  27.35 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  26.04 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  26.4 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  32.35 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  27.72 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  26 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  27.53 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  27.69 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  26.12 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  28.02 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  26.1 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  28.49 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  26.09 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  27.13 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  27.82 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  27.67 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  26.64 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  29.03 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  26.47 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  24.15 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  26.8 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  26.92 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  27.82 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  23.89 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  23.2 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  26.05 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  31.28 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  27.5 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  23.74 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  24.66 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  27.42 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  23.86 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  24.54 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  23.02 
 
 
286 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  25.88 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  27.92 
 
 
494 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  31.28 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  26.36 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  27.19 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  32.69 
 
 
266 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  26.02 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  23.35 
 
 
296 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  31.84 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  20.46 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  25.19 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  28.21 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  26.82 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  27.39 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4622  pyridoxine kinase  27.71 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  26.87 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  24.46 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  26.56 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  24.42 
 
 
290 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  20.08 
 
 
288 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  27.17 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  20.08 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  25.13 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>