232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3710 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3710  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  100 
 
 		 284 aa  591  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0417661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2653  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.86 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0901  pyridoxamine kinase  33.69 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2618  pyridoxamine kinase  34.41 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04110  pyridoxamine kinase  34.75 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2304  pyridoxamine kinase  34.41 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000939996  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1011  pyridoxamine kinase  33.21 
 
 		 290 aa  161  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000463881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1948  pyridoxamine kinase  34.75 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.49187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2201  pyridoxamine kinase  32.75 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0030  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.82 
 
 		 289 aa  151  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1956  phosphomethylpyrimidine kinase  33.7 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03430  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  31 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.176993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2742  pyridoxamine kinase  30.6 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2811  pyridoxamine kinase  32.38 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2994  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.97 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26290  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  31.62 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0675  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  31.18 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000369862  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2757  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.64 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000026444  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0738  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  29.92 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001675 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0796  pyridoxal kinase  25.83 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.887672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0428  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase-like protein  26.88 
 
 		 250 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  25.28 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  25.28 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  25.28 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  25.28 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  25.28 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  28.02 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  21.74 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  23.18 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  22.38 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  22.66 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  27.74 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  22.83 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  24.48 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  22.83 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  24.38 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  22.46 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  22.46 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  22.83 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  22.46 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  29.61 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  22.46 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  22.46 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  22.99 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  28.12 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  28.66 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  24.45 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2881  pyridoxal kinase  26.01 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  25.27 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  23.11 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  25 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  22.71 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  27.98 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  31.08 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  23.69 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  28.39 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0166  phosphomethylpyrimidine kinase  26.18 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  23.5 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  24.58 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  24.27 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  23.76 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  30.41 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  30.41 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  26.52 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  30.41 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  30.41 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  25.95 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  30.41 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  21.76 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  30.41 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  23.73 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  23.63 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  26.92 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  24.64 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  25.82 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  27.75 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  27.17 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  24.61 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  25.41 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1932  phosphomethylpyrimidine kinase  25.13 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  25.83 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  23.11 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  28.77 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  27.17 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  27.17 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  27.17 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  27.17 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  26.32 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  26.7 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  25.1 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  29.93 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0096  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  24.29 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  27.17 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  27.17 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08080  phosphomethylpyrimidine kinase  26.09 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  27.59 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  25.95 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>