More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08080  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 291 aa  560  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  42.73 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  38.95 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  38.35 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  38.35 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.35 
 
 		 266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  37.59 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0854  phosphomethylpyrimidine kinase  43.6 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0599289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  37.19 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  36.46 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  36.92 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  32.04 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  40.55 
 
 		 268 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 		 266 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  37.93 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  39.01 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  35.17 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  40.81 
 
 		 266 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  41.01 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  39.65 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  41.01 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  35.36 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  41.01 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  41.01 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  41.01 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  41.01 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  37.56 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  35.94 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  41.94 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  40.55 
 
 		 266 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  40.55 
 
 		 266 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.64 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  34.63 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  35.44 
 
 		 260 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  33.69 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  33.69 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  33.69 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  33.69 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  33.69 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  37.5 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  37.5 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  42.5 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  34.49 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  37.5 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 		 268 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  39.29 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  37.05 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  39.72 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  33.92 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  37.05 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  43.97 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  38.25 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  39.72 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.64 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  34.46 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  39.36 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  33.8 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4275  phosphomethylpyrimidine kinase  42.81 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.096784  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  34.35 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  34.35 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  34.35 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  34.35 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  34.35 
 
 		 270 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  42.14 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  33.45 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  37.55 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  35.47 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  43.53 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  32.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  35.19 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  39.45 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  34.49 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 		 269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  36.81 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  32.04 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  36.16 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  37.23 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  40.53 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  37.54 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  40.27 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  34.39 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>