More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0854 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0854  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
279 aa  534  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0599289  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  63.44 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  56.88 
 
 
265 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  54.68 
 
 
268 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  53.51 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  52.73 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  50.73 
 
 
266 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  52.55 
 
 
268 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  53.76 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  53.76 
 
 
266 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  53.76 
 
 
266 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  53.33 
 
 
267 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 
266 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 
271 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  51.09 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 
268 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  52.54 
 
 
268 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  51.12 
 
 
267 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  49.26 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  51.87 
 
 
267 aa  232  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 
265 aa  229  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  54.51 
 
 
499 aa  225  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  51.99 
 
 
268 aa  225  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  52.03 
 
 
267 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
266 aa  225  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  54.21 
 
 
269 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
266 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
266 aa  225  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
266 aa  225  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
266 aa  225  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
266 aa  225  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  48.71 
 
 
266 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  48.71 
 
 
266 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
266 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  51.27 
 
 
531 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 
266 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  52.61 
 
 
267 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 
271 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  44.78 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 
268 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
284 aa  218  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  49.82 
 
 
518 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  54.71 
 
 
494 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  54.78 
 
 
268 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  46.52 
 
 
277 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  48.34 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 
285 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 
266 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  47.97 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  41.52 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  51.11 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  42.28 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  53.68 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  43.12 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  47.6 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  48.56 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.2 
 
 
288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.2 
 
 
288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  45.22 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  51.27 
 
 
272 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  55.51 
 
 
269 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  44.93 
 
 
267 aa  210  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  54.78 
 
 
269 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 
323 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  54.41 
 
 
269 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  54.41 
 
 
269 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
295 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 
277 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  54.04 
 
 
269 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 
268 aa  208  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  54.95 
 
 
269 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 
335 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  54.41 
 
 
269 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 
288 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.91 
 
 
264 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  56.52 
 
 
271 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  51.81 
 
 
267 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.79 
 
 
270 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  44 
 
 
264 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 
336 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
297 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  51.29 
 
 
335 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  42.48 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  54.15 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  45.02 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 
260 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50.72 
 
 
267 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  49.27 
 
 
304 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  50.72 
 
 
267 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  48.31 
 
 
269 aa  198  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
269 aa  198  9e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  48.91 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  53.68 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.8 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  40.29 
 
 
270 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  42.12 
 
 
269 aa  196  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>