280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2629 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  100 
 
 
288 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  99.65 
 
 
288 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  99.31 
 
 
288 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  98.96 
 
 
288 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  99.31 
 
 
288 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  67.74 
 
 
283 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  67.74 
 
 
283 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  67.74 
 
 
283 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  67.74 
 
 
283 aa  394  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  67.74 
 
 
283 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  67.74 
 
 
283 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  67.38 
 
 
283 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  67.03 
 
 
283 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  67.03 
 
 
283 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  67.51 
 
 
278 aa  381  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  47.97 
 
 
288 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  43.51 
 
 
279 aa  231  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  48.51 
 
 
303 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  46.28 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  36.82 
 
 
302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  35.96 
 
 
282 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01187  pyridoxal kinase  40.55 
 
 
302 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0980044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  35.96 
 
 
289 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  34.05 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  34.69 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  33.58 
 
 
278 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  34.59 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  34.31 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  33.72 
 
 
288 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  37.23 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  34.51 
 
 
271 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  32.58 
 
 
283 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  31.87 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  35.38 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  30.94 
 
 
282 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  35.64 
 
 
298 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  31.92 
 
 
313 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  35.64 
 
 
298 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  39.66 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  34.91 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  33.33 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  32.82 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  29.89 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  29.28 
 
 
286 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  29.07 
 
 
286 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  29.28 
 
 
286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  29.77 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  28.52 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  32.95 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  30.8 
 
 
288 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  39.66 
 
 
283 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  32.22 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  30.8 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  29.3 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  29.3 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  29.59 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  29.66 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  28.15 
 
 
282 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  32.69 
 
 
293 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  30.04 
 
 
293 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  28.57 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  29.17 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  28.91 
 
 
286 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  28.91 
 
 
286 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  30.37 
 
 
283 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  28.91 
 
 
286 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  28.91 
 
 
286 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  30.37 
 
 
283 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  29.23 
 
 
289 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  28.41 
 
 
286 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  38.55 
 
 
283 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  28.12 
 
 
286 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  28.12 
 
 
286 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  28.12 
 
 
286 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  30.04 
 
 
290 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  29.21 
 
 
286 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  28.12 
 
 
286 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  28.9 
 
 
288 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  34.06 
 
 
291 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  29.28 
 
 
290 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  28.41 
 
 
286 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  28.9 
 
 
290 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  28.52 
 
 
290 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  28.9 
 
 
290 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  27.78 
 
 
286 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  27.31 
 
 
289 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  28.52 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  30.38 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  29.32 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  28.52 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  30.68 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  32.1 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  31.66 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  29 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  29.74 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  30.9 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  27.88 
 
 
312 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2881  pyridoxal kinase  25.94 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  26.03 
 
 
287 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>