More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1437 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  100 
 
 		 282 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  90.78 
 
 		 289 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  92.05 
 
 		 271 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  69.23 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  45.42 
 
 		 288 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  44.78 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  46.67 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  46.42 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  43.73 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  44.98 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  44.89 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  38.31 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  43.11 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  40.61 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  37.93 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01187  pyridoxal kinase  43.58 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0980044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  38.7 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  39.04 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  40.37 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  36.33 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  35.74 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  35.96 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  35.96 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  38.43 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  35.58 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  35.96 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  37.78 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  38.02 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  40.69 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  37.5 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  36.4 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  39.01 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  35.4 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  33.45 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  34.93 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  32.18 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  32.18 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  32.18 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  32.18 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  32.18 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  32.18 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  34.45 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  40 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  37.5 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  31.8 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  39.01 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  32.57 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  31.8 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  37.36 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  34.63 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  35.6 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  37.93 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  32.08 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  36.23 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  36.23 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  38.57 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.06 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  35.94 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  34.04 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  35.36 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  33.45 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  34 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  34 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  34 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  34 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  33.92 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  34.88 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  34.88 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  32.96 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  31.73 
 
 		 286 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  32.47 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  35.39 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  35.36 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  37.87 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  33.87 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  34.07 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  34.4 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  32.96 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  34.39 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  36.19 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  34.4 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  37.78 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  35.92 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  34.14 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  36.16 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04250  bud site selection-related protein, putative  41.44 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  33.2 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  33.2 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  33.2 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  33.2 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  33.2 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  33.2 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  33.2 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  33.2 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  41.14 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  33.6 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  32.53 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  34.91 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  33.73 
 
 		 354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  31.18 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>