174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4006 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  74.56 
 
 		 283 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  74.47 
 
 		 283 aa  428  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  60.42 
 
 		 290 aa  325  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  56.89 
 
 		 283 aa  321  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  58.9 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  54.7 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  55.2 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  51.42 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  53.9 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  51.99 
 
 		 282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  56.27 
 
 		 282 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  48.92 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  52.14 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  51.25 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  51.25 
 
 		 283 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  50.53 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  45.58 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  45.23 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  45.23 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  46.62 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  44.52 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  44.17 
 
 		 288 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  43.82 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  43.66 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  43.31 
 
 		 286 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  43.37 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  44.72 
 
 		 312 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  43.66 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  43.07 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  43.66 
 
 		 286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  41.9 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  45.52 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  42.25 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  42.25 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  41.55 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  42.25 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  42.25 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  43.01 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  41.55 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  42.05 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  42.45 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  40.14 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  38.87 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  41.7 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  42.45 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  41.55 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  42.45 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  42.45 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  38.16 
 
 		 289 aa  205  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  41.55 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  41.55 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  41.55 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0266148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  41.55 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  41.55 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  41.7 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  41.55 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  41.7 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  41.9 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  41.55 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  41.7 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  42.45 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  42.45 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  42.09 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  42.09 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  42.09 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  41.73 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  37.91 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  41.34 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  36.75 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  38.01 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  37.96 
 
 		 288 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  39.47 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  40.45 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  37.92 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  38.15 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  41.26 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  42.29 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  38.7 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  37.32 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  36.43 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  35.82 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  35 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  34.29 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  37.12 
 
 		 278 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  36.62 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  36.17 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  37.19 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  37.19 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  40.47 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  37.46 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  39.56 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01187  pyridoxal kinase  35.59 
 
 		 302 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0980044  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2881  pyridoxal kinase  34.04 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04250  bud site selection-related protein, putative  39.88 
 
 		 402 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203655  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  29.63 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  29.63 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  29.63 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  29.63 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  29.63 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>