207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2218 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  68.93 
 
 		 282 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  69.64 
 
 		 282 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  66.43 
 
 		 283 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  68.2 
 
 		 283 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  66.43 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  58.18 
 
 		 282 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  67.86 
 
 		 282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  64.13 
 
 		 282 aa  354  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  54.55 
 
 		 299 aa  308  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  55.27 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  54.55 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  50.7 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  57.3 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  53.9 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  49.29 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  52.6 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  47.55 
 
 		 313 aa  251  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  44.06 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  44.41 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  46.29 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  46.29 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  45.94 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  45.58 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  44.29 
 
 		 290 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  45.23 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  45.23 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  43.82 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  44.52 
 
 		 286 aa  222  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  44.52 
 
 		 354 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  42.24 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  41.52 
 
 		 290 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  41.52 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  41.52 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  42.6 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  44.52 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  44.52 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  44.52 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  41.49 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  39.86 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  39.86 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  41.52 
 
 		 287 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  44.17 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  44.52 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  39.5 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  44.17 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  39.5 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  41.52 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  42.96 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  44.17 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  39.86 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  39.86 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  39.86 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  39.86 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  39.86 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  39.86 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  39.5 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  39.5 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  38.43 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  38.81 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  39.58 
 
 		 286 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  39.93 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  38.43 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  38.43 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  37.86 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  38.79 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  37.01 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  39.29 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  39.22 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  36.81 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  41.44 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  40.37 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  45.39 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  35.49 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  36.67 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  37.22 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  35.19 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  39.38 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  35.84 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  39.04 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  36.63 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  36.26 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  35.9 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  34.09 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  39.74 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  37.85 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  35.29 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01187  pyridoxal kinase  37.16 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0980044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  36.63 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04250  bud site selection-related protein, putative  38.69 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  36.57 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  34.18 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  34.18 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  33.69 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  28.04 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  32 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  29.17 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  28.52 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  28.52 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  29.17 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>