More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0096 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0096  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  38.31 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  40.53 
 
 
274 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  40.53 
 
 
274 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  40.15 
 
 
274 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  40.15 
 
 
274 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  38.7 
 
 
271 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  40.15 
 
 
273 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  39.77 
 
 
274 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  36.68 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0226  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
277 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  35.5 
 
 
269 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0990  phosphomethylpyrimidine kinase  35.66 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0186  phosphomethylpyrimidine kinase  35.16 
 
 
264 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0750  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  37.4 
 
 
267 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
252 aa  145  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21390  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0492  phosphomethylpyrimidine kinase  34.78 
 
 
262 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  34.87 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  34.59 
 
 
266 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  33.99 
 
 
270 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  33.99 
 
 
270 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  33.6 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  32.56 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2795  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.92 
 
 
283 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0136558  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  32.81 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  34.77 
 
 
267 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  36.19 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0166  phosphomethylpyrimidine kinase  32.92 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  32.68 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  34.35 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  34.26 
 
 
278 aa  129  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  32.3 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  33.46 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  35.23 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  33.61 
 
 
260 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  34.44 
 
 
267 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  32.96 
 
 
260 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  30.86 
 
 
285 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  35.11 
 
 
257 aa  123  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  35.14 
 
 
270 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  34.07 
 
 
270 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  34.75 
 
 
273 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  34.32 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  33.33 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  33.61 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  33.58 
 
 
273 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2928  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.3 
 
 
263 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148017  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  34.55 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  28.85 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  35.63 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  31.73 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0721  phosphomethylpyrimidine kinase  29.52 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  30.19 
 
 
268 aa  118  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  32.71 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0693  phosphomethylpyrimidine kinase  32.69 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03020  phosphomethylpyrimidine kinase  29.55 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30100  phosphomethylpyrimidine kinase  31.3 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0593  phosphomethylpyrimidine kinase  30 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  35.27 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  32.26 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  34.2 
 
 
269 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  31.4 
 
 
263 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1150  phosphomethylpyrimidine kinase  30.36 
 
 
277 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0407  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  31.44 
 
 
263 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  33.84 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  31.16 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  32.17 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  31.48 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  31.62 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  32.93 
 
 
450 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  32.79 
 
 
444 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  32.62 
 
 
484 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  30.86 
 
 
268 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  29.1 
 
 
269 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
271 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3519  phosphomethylpyrimidine kinase  30.8 
 
 
275 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.728069  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  31.4 
 
 
268 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  28.68 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  30.86 
 
 
271 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0143  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  30.45 
 
 
275 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>