More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03430 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03430  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  100 
 
 
287 aa  589  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.176993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2994  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  73.61 
 
 
293 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26290  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  72.28 
 
 
295 aa  409  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0030  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  62.59 
 
 
289 aa  379  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0675  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  58.25 
 
 
290 aa  328  4e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000369862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2653  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  36.88 
 
 
284 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147822  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1956  phosphomethylpyrimidine kinase  35.64 
 
 
272 aa  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04110  pyridoxamine kinase  35.71 
 
 
290 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2742  pyridoxamine kinase  39.23 
 
 
300 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2201  pyridoxamine kinase  36.26 
 
 
303 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1948  pyridoxamine kinase  33.81 
 
 
294 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.49187  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1011  pyridoxamine kinase  34.8 
 
 
290 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000463881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2811  pyridoxamine kinase  37.09 
 
 
297 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0901  pyridoxamine kinase  32.86 
 
 
293 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2618  pyridoxamine kinase  31.77 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2304  pyridoxamine kinase  32.01 
 
 
280 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000939996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3710  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0417661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2757  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.17 
 
 
271 aa  135  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000026444  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0738  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  32.28 
 
 
275 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001675 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0796  pyridoxal kinase  28.47 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.887672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0428  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase-like protein  27.98 
 
 
250 aa  92.8  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  29.41 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  27.17 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  30.68 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  31.67 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  27.15 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  27.14 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  28.52 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  27.94 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  28.41 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  27.86 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  27.86 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  27.83 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  31.53 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  27.7 
 
 
492 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  28.83 
 
 
497 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  28.03 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  28.03 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  28.03 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  28.03 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  28.03 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  28.41 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  30 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  28.41 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  29.87 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  29.87 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  30.43 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  29.58 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  29.58 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  27.31 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  28.33 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  29.73 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  28.95 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  27.57 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  28.95 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  29.39 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  28.95 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  28.98 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  27.31 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  28.69 
 
 
354 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  28.03 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  27.61 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  27.37 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  28.46 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  24.58 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  29.57 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  28.95 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  27.97 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  27.32 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  27.55 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  27.55 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  26.98 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0184  phosphomethylpyrimidine kinase  27.85 
 
 
403 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000409945  normal  0.070974 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0603  phosphomethylpyrimidine kinase  30.66 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  28.51 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0617  phosphomethylpyrimidine kinase  30.66 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  26.77 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  28.5 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  25 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  29.2 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  24.63 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  29.89 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  24.63 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  28.33 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1505  phosphomethylpyrimidine kinase  29.61 
 
 
269 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0164576  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  29.2 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  27.17 
 
 
271 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  26.19 
 
 
267 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  27.82 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  24.7 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  27.82 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  24.63 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  24.63 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  28.57 
 
 
263 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  26.6 
 
 
599 aa  58.9  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  26.37 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  26.37 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  26.37 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4658  phosphomethylpyrimidine kinase  26.03 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46443  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  25.54 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>