More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2304 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2304  pyridoxamine kinase  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000939996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2618  pyridoxamine kinase  95.71 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04110  pyridoxamine kinase  45.85 
 
 		 290 aa  265  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1948  pyridoxamine kinase  45.36 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.49187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0901  pyridoxamine kinase  43.8 
 
 		 293 aa  255  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1011  pyridoxamine kinase  44.73 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000463881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2742  pyridoxamine kinase  43.84 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2201  pyridoxamine kinase  42.75 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2811  pyridoxamine kinase  42.86 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2653  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.37 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147822  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1956  phosphomethylpyrimidine kinase  38.6 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2757  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  37.55 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000026444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3710  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  34.41 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0417661  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0738  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  37.55 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001675 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0796  pyridoxal kinase  38.01 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.887672  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0030  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  31.37 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03430  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  32.01 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.176993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2994  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  29.86 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0675  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  30.47 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000369862  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26290  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  30.29 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0428  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase-like protein  29.15 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  27 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  27.17 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  26.79 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  26.42 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  26.42 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  26.42 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  26.42 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  26.42 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  26.79 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  28.22 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  29.27 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  27.27 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  24.79 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  26.98 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  30.65 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  27.6 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0101  phosphomethylpyrimidine kinase  27.73 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  27.73 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  26.19 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  27.57 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  26.19 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  27.57 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  26.24 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  27.31 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3381  pyridoxal kinase  28.5 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0723053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  28.49 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  24.53 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  27.82 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  26.23 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  28.19 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  25.89 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  25.91 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  27.59 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  27.82 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  23.6 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  28.49 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  29.03 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  25.31 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  23.48 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  27.42 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  30.68 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  26.54 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  32.52 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  23.74 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  32.96 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  26.83 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  25.84 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  27.04 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  32.96 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  24.9 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3514  pyridoxal kinase  26.02 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  23.08 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  23.08 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  26.34 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  28.8 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  23.98 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  25.38 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  27.6 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  26.67 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0629  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  25.19 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246036  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  34.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  28.81 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  24.46 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4914  phosphomethylpyrimidine kinase  25.56 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43081 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  25.39 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  25.71 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00132  phosphomethylpyrimidine kinase  23.16 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  26.05 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1505  phosphomethylpyrimidine kinase  25.41 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0164576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  22.22 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  25.25 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  24.73 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  26.83 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>