297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2742 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2742  pyridoxamine kinase  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2201  pyridoxamine kinase  78.08 
 
 
303 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2811  pyridoxamine kinase  77.44 
 
 
297 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1948  pyridoxamine kinase  61.72 
 
 
294 aa  374  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.49187  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04110  pyridoxamine kinase  56.55 
 
 
290 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0901  pyridoxamine kinase  57.19 
 
 
293 aa  357  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1011  pyridoxamine kinase  59.25 
 
 
290 aa  349  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000463881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2618  pyridoxamine kinase  44.2 
 
 
280 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2304  pyridoxamine kinase  43.84 
 
 
280 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000939996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2653  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  44.65 
 
 
284 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147822  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1956  phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 
272 aa  195  6e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0030  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  38.43 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0675  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  38.52 
 
 
290 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000369862  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03430  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  39.23 
 
 
287 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.176993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2757  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.13 
 
 
271 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000026444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2994  Phosphomethylpyrimidine kinase type-1  39.13 
 
 
293 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26290  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  38.49 
 
 
295 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0796  pyridoxal kinase  28.78 
 
 
264 aa  150  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.887672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3710  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  30.6 
 
 
284 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0417661  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0738  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase  32.94 
 
 
275 aa  135  8e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0428  pyridoxal/pyridoxine/pyridoxamine kinase-like protein  27.54 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  28.93 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  28.82 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  28.52 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  27.84 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  27.06 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  27.06 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  27.45 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  27.45 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  26.67 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  28.92 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  28.63 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  28.24 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  25.97 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  25.97 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  31.82 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  25.97 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  25.97 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  27.67 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  28.28 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  31.06 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  26.32 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  27.2 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  25.97 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  28.51 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  27.95 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  26.47 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  25.1 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  25.58 
 
 
287 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  25.58 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  26.47 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  27.82 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  28.27 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  26.1 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  26.1 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  26.1 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  26.1 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  26.1 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  28.24 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  31.31 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  25.29 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  26.71 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  25.38 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  29.32 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  27.02 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  26.1 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  25.27 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  24.34 
 
 
510 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  27.97 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  26.77 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  26.77 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  26.77 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  26.77 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  26.77 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  27.98 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  26.03 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  27.07 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  25.87 
 
 
263 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5207  pyridoxal kinase  26.38 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2288  phosphomethylpyrimidine kinase  24.6 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  24.81 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  28.17 
 
 
267 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  25.69 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  27.7 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  28.09 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  26.48 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5593  pyridoxal kinase  26.38 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5415  pyridoxal kinase  26.38 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  26.48 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  26.38 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  26.05 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  27.12 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5542  pyridoxal kinase  26.38 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  26.48 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  24.44 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>