More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5659 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  78.33 
 
 		 423 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 421 aa  851    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  79 
 
 		 423 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  77.91 
 
 		 420 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  78.57 
 
 		 442 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  78.66 
 
 		 422 aa  643    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  74 
 
 		 445 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  73.87 
 
 		 434 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  73.49 
 
 		 427 aa  616  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  72.32 
 
 		 425 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  73.5 
 
 		 453 aa  604  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  74.94 
 
 		 452 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  76.66 
 
 		 447 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  71.33 
 
 		 435 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  73.01 
 
 		 432 aa  584  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  70.88 
 
 		 426 aa  584  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  71.81 
 
 		 432 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  70.05 
 
 		 426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  73.43 
 
 		 412 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  71.6 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  73.73 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  70.12 
 
 		 435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  69.88 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 422 aa  570  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  69.16 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  67.15 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  68.56 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 432 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 415 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.71 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  58.55 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.33 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  56.91 
 
 		 437 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 421 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 438 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  56.21 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  58.22 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.73 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  56.41 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>