More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0793 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  100 
 
 		 395 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  71.32 
 
 		 386 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  70.37 
 
 		 382 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  70.37 
 
 		 382 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  67.44 
 
 		 387 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  70.11 
 
 		 382 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  68.34 
 
 		 382 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  70.13 
 
 		 387 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  68.41 
 
 		 384 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  63.71 
 
 		 387 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  64.71 
 
 		 386 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  62.28 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  60.51 
 
 		 392 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  62.6 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  57.64 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  58.69 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  55.98 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  62.37 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  57 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  54.02 
 
 		 404 aa  411  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  55.53 
 
 		 404 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  59.85 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  60.34 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  55.16 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  54.44 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  58.73 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  53.63 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  50.36 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  55.67 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  46.91 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  48.04 
 
 		 406 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  43.11 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 672 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 446 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  35.29 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.55 
 
 		 650 aa  123  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 		 404 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 408 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.53 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.29 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36.16 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 536 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 438 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 430 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  34.37 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  29.91 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  33.02 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.01 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.01 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>