More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0380 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  100 
 
 
447 aa  864    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  45.54 
 
 
448 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  44 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  44.34 
 
 
481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.94 
 
 
456 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.86 
 
 
453 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.54 
 
 
469 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  39.04 
 
 
481 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  38.72 
 
 
496 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  31.9 
 
 
447 aa  155  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.19 
 
 
447 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  30.58 
 
 
445 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  27.13 
 
 
444 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.98 
 
 
444 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  30.25 
 
 
445 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25.19 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.69 
 
 
444 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  29.67 
 
 
232 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.2 
 
 
254 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  29.02 
 
 
434 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  28.67 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  23.67 
 
 
441 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  30.37 
 
 
460 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.87 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.47 
 
 
381 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.75 
 
 
421 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  32.06 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.27 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  32.84 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.7 
 
 
430 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.75 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.76 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  24.79 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.64 
 
 
261 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  31.87 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.84 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.19 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.76 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.21 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.66 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.58 
 
 
691 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  28.29 
 
 
381 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.43 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.8 
 
 
625 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  32.67 
 
 
760 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.76 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  31.27 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  30.16 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  27.8 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  33.19 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  29.17 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.58 
 
 
366 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.43 
 
 
465 aa  77  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.11 
 
 
669 aa  76.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  26.43 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  28.23 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.49 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.81 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  32.38 
 
 
351 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  32.79 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  31.33 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  27.92 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  27.85 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.83 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  28.26 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  27.15 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  32.01 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  26.48 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  32.13 
 
 
586 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  30.99 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  29.73 
 
 
670 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.47 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.82 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  30.4 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  25.71 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  26.36 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.22 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  27.05 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  25.71 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  30.15 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.45 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.04 
 
 
702 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.85 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.45 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.05 
 
 
699 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.71 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.13 
 
 
585 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.61 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  29.09 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.51 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  30.12 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  30.12 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.09 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  31.29 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  27.04 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.91 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>