146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1237 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 89 aa  161  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  45.21 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  45.21 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  46.05 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  38.71 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  34.62 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  41.25 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  42.47 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  42.68 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  41.43 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  34.21 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  34.21 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  34.21 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  34.21 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  38.16 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  34.21 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  33.33 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  45 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  34.21 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  39.02 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  41.56 
 
 		 199 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  34.21 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  33.33 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  34.67 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  34.67 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  34.67 
 
 		 196 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  43.94 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  41.43 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  43.94 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  43.94 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  39.39 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  43.94 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  38.81 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  39.66 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  39.02 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  35.79 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  32.39 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  44.26 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  46.27 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  31.71 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  41.38 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  40.28 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  35.8 
 
 		 180 aa  43.9  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  41.1 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  39.73 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  32.88 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  36.59 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  41.54 
 
 		 182 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2437  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  32 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  40 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 184 aa  42  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 192 aa  42  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0790  hythetical protein  38.03 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000412009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  40.98 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  32 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  30.99 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  34.62 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  30.67 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  41.79 
 
 		 124 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>