237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0592 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 300 aa  565  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.36 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.27 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  37.59 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  38.25 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  32.23 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  34.64 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  35.56 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.03 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  36.5 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  34.07 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.29 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  32.24 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  32.59 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  33.1 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  33.1 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  30.88 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  32.46 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  32.62 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  30.66 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  31.85 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.55 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  31.97 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  35 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  35.88 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  30.54 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.88 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  29.25 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  32.18 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  32.19 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  29.76 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  32.95 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  29.96 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  32.38 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  29.48 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.94 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.31 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  29.67 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  30.77 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.94 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  32.61 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  29.37 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  32.61 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  34.09 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  29.6 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.78 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  29.39 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  31.77 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  29.47 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  32.09 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  31.51 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.99 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  26.86 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  29.59 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.94 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  31.33 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  28.33 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  31.33 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  25.9 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  29.76 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.93 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  28.92 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  31.05 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  24.67 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  30.92 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  30.92 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  29.76 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  28.91 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  27.63 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  29.23 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  29.25 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.66 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  30.74 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  26.87 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  28.71 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>