More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0925 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  95.38 
 
 
606 aa  1176    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
606 aa  1221    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  76.97 
 
 
607 aa  943    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  52.68 
 
 
612 aa  643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  95.04 
 
 
606 aa  1165    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  54.92 
 
 
622 aa  643    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  52.92 
 
 
613 aa  628  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  54.74 
 
 
610 aa  623  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  51.93 
 
 
617 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  52.51 
 
 
649 aa  609  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  50.33 
 
 
602 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  50.17 
 
 
602 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  50.17 
 
 
602 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  46.43 
 
 
604 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 
604 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 
604 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  43.93 
 
 
605 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
597 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 
618 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 
608 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 
594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 
626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  41.64 
 
 
623 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 
602 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  40.03 
 
 
606 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
603 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 
601 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 
602 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 
604 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
607 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.99 
 
 
606 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 
605 aa  382  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  39.83 
 
 
633 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 
600 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 
607 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 
602 aa  382  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  39.97 
 
 
599 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 
619 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  40.07 
 
 
611 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 
603 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
600 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 
603 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
597 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
616 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
598 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
597 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
597 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  40.8 
 
 
599 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 
606 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 
599 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  40.2 
 
 
599 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 
610 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 
604 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.16 
 
 
598 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
595 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
610 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 
597 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
633 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 
599 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 
615 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 
592 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 
622 aa  369  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
612 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
600 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 
602 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 
602 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 
601 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
596 aa  363  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 
606 aa  362  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
599 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
607 aa  362  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 
597 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 
632 aa  359  7e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.31 
 
 
606 aa  359  7e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.88 
 
 
610 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
610 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  39.39 
 
 
591 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  38.02 
 
 
600 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 
609 aa  356  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  38.9 
 
 
599 aa  356  8.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 
630 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 
603 aa  353  5.9999999999999994e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
602 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  37.48 
 
 
602 aa  350  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
592 aa  349  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  36.94 
 
 
592 aa  348  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 
601 aa  348  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 
649 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 
593 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34 
 
 
601 aa  347  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0623  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
647 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431706  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.78 
 
 
587 aa  346  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
616 aa  346  7e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 
601 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  36.25 
 
 
607 aa  343  4e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
613 aa  343  7e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 
597 aa  343  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 
607 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
597 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
597 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>