149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2655 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  52 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  46.32 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  46.32 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  46.32 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  44.94 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  52.5 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  52.86 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  45.71 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  51.35 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  51.28 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  47.56 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  50 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  50 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  52.46 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  51.43 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  43.16 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  54.39 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  50.82 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  49.32 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  41.03 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  50.88 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  50.88 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  50.82 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  41.57 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  49.21 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  46.48 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  38.95 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  42.53 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  43.53 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  49.02 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  40.74 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  40.51 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  31.58 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  40.79 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  35 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  40.54 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  40.54 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  35.63 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  33.66 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  33.66 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  32.67 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  36.67 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  35.56 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  37.04 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  34.48 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0166  hypothetical protein  37.04 
 
 		 189 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000107926  hitchhiker  0.0000185577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  35.63 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  35.63 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  37.63 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  37.89 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  35.48 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  37.5 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  32.93 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  30.59 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  36.56 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  36.56 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  36.56 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  36.56 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  36.56 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0178  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00798567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  30 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  39.02 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  33.71 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  38.95 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  38.55 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  35.37 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  34.21 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  36.05 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  34.21 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  34.62 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  26.67 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.47 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2437  protein of unknown function YGGT  41.43 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  39.02 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  38.81 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>