More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4297 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  100 
 
 		 640 aa  1315    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.65 
 
 		 587 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 604 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.79 
 
 		 588 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.67 
 
 		 587 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.98 
 
 		 596 aa  298  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.98 
 
 		 605 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40 
 
 		 619 aa  292  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  34.65 
 
 		 578 aa  290  7e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.72 
 
 		 583 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.31 
 
 		 582 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.9 
 
 		 601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  36.02 
 
 		 599 aa  281  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  33.13 
 
 		 600 aa  281  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.58 
 
 		 595 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.44 
 
 		 599 aa  281  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.46 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  40.18 
 
 		 639 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  37.16 
 
 		 645 aa  278  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  37.13 
 
 		 638 aa  277  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.56 
 
 		 613 aa  277  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  38.82 
 
 		 636 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  36.42 
 
 		 660 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  38.31 
 
 		 660 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  36.94 
 
 		 676 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  36.85 
 
 		 622 aa  275  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.89 
 
 		 604 aa  274  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  36.65 
 
 		 622 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  36.09 
 
 		 604 aa  273  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  36.77 
 
 		 800 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  36.63 
 
 		 625 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  36.63 
 
 		 625 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.9 
 
 		 584 aa  272  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  38.4 
 
 		 625 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  35.63 
 
 		 621 aa  270  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.07 
 
 		 614 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.02 
 
 		 599 aa  270  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  38.67 
 
 		 624 aa  270  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  38.67 
 
 		 624 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0338  DNA primase  38.67 
 
 		 624 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1712  DNA primase  38.67 
 
 		 624 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0372  DNA primase  38.67 
 
 		 624 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  38.67 
 
 		 624 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  38.67 
 
 		 624 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.48 
 
 		 544 aa  269  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0620  DNA primase  39.02 
 
 		 625 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.33 
 
 		 601 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.3 
 
 		 593 aa  267  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.73 
 
 		 601 aa  266  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  37.2 
 
 		 659 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.99 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  35.04 
 
 		 703 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  38.59 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  35.88 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  33.92 
 
 		 605 aa  264  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  36.06 
 
 		 599 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  35.4 
 
 		 630 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  39.82 
 
 		 604 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  39.58 
 
 		 674 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.78 
 
 		 626 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  35.23 
 
 		 613 aa  261  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  39.04 
 
 		 613 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2227  DNA primase  37.67 
 
 		 671 aa  261  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.914663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  37.14 
 
 		 623 aa  261  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  37.22 
 
 		 622 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  36.04 
 
 		 666 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  31.29 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  36.1 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.49 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.49 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.49 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  35.41 
 
 		 652 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.49 
 
 		 571 aa  258  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.49 
 
 		 598 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.49 
 
 		 598 aa  258  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.49 
 
 		 598 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.49 
 
 		 598 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  38.73 
 
 		 600 aa  258  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.49 
 
 		 598 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  36.43 
 
 		 639 aa  257  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  37.44 
 
 		 571 aa  256  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  36.86 
 
 		 602 aa  256  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  37.66 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.87 
 
 		 617 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  37.73 
 
 		 603 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  35.36 
 
 		 669 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  34.01 
 
 		 573 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  34.44 
 
 		 606 aa  254  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  34.28 
 
 		 611 aa  253  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  38.13 
 
 		 603 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  37.73 
 
 		 603 aa  253  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0761  DNA primase  37.22 
 
 		 607 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.3 
 
 		 595 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.21 
 
 		 656 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  33.12 
 
 		 595 aa  252  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.49 
 
 		 666 aa  251  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  34.35 
 
 		 623 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  36.09 
 
 		 576 aa  251  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  36.43 
 
 		 576 aa  250  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  33.4 
 
 		 594 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>