More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4231 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 748 aa  1540    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  36.11 
 
 		 802 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  37.35 
 
 		 773 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  36.73 
 
 		 818 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  35.94 
 
 		 804 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  35.37 
 
 		 841 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 795 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  36.09 
 
 		 797 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  37.69 
 
 		 779 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  35.47 
 
 		 796 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  37.55 
 
 		 794 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  37.65 
 
 		 810 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  35.4 
 
 		 852 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 		 805 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  37.58 
 
 		 804 aa  458  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  36.86 
 
 		 819 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  36.72 
 
 		 819 aa  456  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  36.77 
 
 		 797 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  37.4 
 
 		 823 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  36.29 
 
 		 818 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  36.53 
 
 		 862 aa  452  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  36.59 
 
 		 819 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  35.01 
 
 		 827 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  37.05 
 
 		 852 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  36.91 
 
 		 852 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  36.97 
 
 		 833 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  36.97 
 
 		 805 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  38.26 
 
 		 797 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  34.79 
 
 		 829 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  37.1 
 
 		 852 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  37.89 
 
 		 766 aa  442  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  35.22 
 
 		 771 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  36.02 
 
 		 805 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  38.09 
 
 		 793 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  36.39 
 
 		 808 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  37.79 
 
 		 799 aa  442  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  36.43 
 
 		 805 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  35.54 
 
 		 778 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  37.82 
 
 		 802 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  34.78 
 
 		 809 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  37.15 
 
 		 791 aa  436  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  35.56 
 
 		 796 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  35.35 
 
 		 804 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  36.24 
 
 		 831 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  36.7 
 
 		 791 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  35.83 
 
 		 797 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  36.64 
 
 		 824 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 		 819 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  36.25 
 
 		 833 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  36.4 
 
 		 774 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 807 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  36.5 
 
 		 792 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  35.69 
 
 		 797 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  34.85 
 
 		 804 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 797 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 797 aa  429  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  35.3 
 
 		 794 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  37.34 
 
 		 838 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  35.39 
 
 		 803 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  36.85 
 
 		 839 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 795 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  34.89 
 
 		 818 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  35.3 
 
 		 794 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  34.17 
 
 		 831 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  36.35 
 
 		 833 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  35.38 
 
 		 804 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  34.34 
 
 		 807 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  34.13 
 
 		 843 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  36.4 
 
 		 777 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  36.48 
 
 		 839 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 797 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  36.26 
 
 		 777 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  37.21 
 
 		 790 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  36.71 
 
 		 839 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  37.55 
 
 		 840 aa  422  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  34.61 
 
 		 835 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  36.85 
 
 		 839 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  36.85 
 
 		 839 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 		 840 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  34.73 
 
 		 830 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  36.4 
 
 		 801 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 		 846 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  34.62 
 
 		 796 aa  419  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 		 840 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  36.95 
 
 		 852 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 840 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  35.96 
 
 		 836 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 		 840 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 837 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 840 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  35.54 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 817 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  34.75 
 
 		 854 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  34.44 
 
 		 830 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  35.15 
 
 		 796 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  37.06 
 
 		 797 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  35.01 
 
 		 799 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  34.88 
 
 		 830 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  35.01 
 
 		 799 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  36.47 
 
 		 908 aa  412  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>