180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4119 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  43.32 
 
 
285 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  43.32 
 
 
285 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  41.52 
 
 
320 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  40.79 
 
 
308 aa  232  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  42.75 
 
 
305 aa  232  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  41.52 
 
 
296 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  38.99 
 
 
304 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  41.88 
 
 
298 aa  225  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  40 
 
 
301 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  41.01 
 
 
278 aa  214  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 
309 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  37.36 
 
 
275 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  37.76 
 
 
603 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  37.99 
 
 
309 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  38.81 
 
 
607 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  37.23 
 
 
282 aa  188  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  34.44 
 
 
305 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  38.03 
 
 
280 aa  175  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
295 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  33.85 
 
 
279 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  33.22 
 
 
295 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  33.94 
 
 
301 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  36.24 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
276 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  31.6 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  33.94 
 
 
276 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  34.06 
 
 
276 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 
322 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 
283 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 
313 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  32.01 
 
 
301 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 
276 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  31.89 
 
 
320 aa  149  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  31.43 
 
 
299 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 
301 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 
349 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.85 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 
289 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  31.34 
 
 
280 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 
284 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.61 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.49 
 
 
320 aa  92  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.39 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.09 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.21 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  28.38 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.58 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  25.71 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  23.28 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.64 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  21 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  20.55 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  20.55 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  21.1 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  20.25 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  20.25 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  20.25 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  20.25 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  20.25 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  24.6 
 
 
326 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  20.25 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  19.7 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  26.22 
 
 
251 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  20.19 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  24.32 
 
 
319 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  22.95 
 
 
314 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  24.37 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  23.03 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  21.82 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  24.45 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  20.75 
 
 
309 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.58 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  25.45 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 
235 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  23.15 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  24.42 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25.93 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  21.69 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  22.52 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2269  beta-lactamase domain protein  22.64 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  21.69 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  21.69 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  21.69 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  21.69 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  21.88 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  21.69 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  21.54 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  19.27 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.25 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  20.85 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0696  ribonuclease Z  22.26 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>