More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3982 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  100 
 
 
445 aa  899  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  51.82 
 
 
426 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  51.08 
 
 
444 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  48.37 
 
 
405 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  46.08 
 
 
431 aa  357  3e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  49.38 
 
 
422 aa  357  3e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  47.19 
 
 
430 aa  355  7e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  47.8 
 
 
441 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  46.42 
 
 
428 aa  337  2e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  46.45 
 
 
426 aa  332  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  43.02 
 
 
426 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  45.7 
 
 
438 aa  322  1e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  45.34 
 
 
440 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  45.34 
 
 
459 aa  312  7e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  47.26 
 
 
444 aa  310  3e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  43.26 
 
 
430 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  41.81 
 
 
444 aa  303  5e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  43.07 
 
 
432 aa  302  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  43.84 
 
 
455 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  40.98 
 
 
431 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  41.28 
 
 
426 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  40.63 
 
 
434 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  38.88 
 
 
437 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  39.77 
 
 
433 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  40.91 
 
 
433 aa  285  2e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  40.93 
 
 
423 aa  282  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  41.97 
 
 
419 aa  275  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  38.1 
 
 
428 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  39.66 
 
 
407 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  40.32 
 
 
433 aa  262  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  40 
 
 
429 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  39.71 
 
 
412 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  37.37 
 
 
407 aa  253  4e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  40.53 
 
 
424 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  38.55 
 
 
414 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  40.29 
 
 
421 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  39.28 
 
 
417 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  39.28 
 
 
417 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  39.28 
 
 
417 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  39.75 
 
 
408 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  39.75 
 
 
408 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  39.75 
 
 
408 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  39.3 
 
 
407 aa  249  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  39.85 
 
 
402 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  38.86 
 
 
411 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  41.95 
 
 
423 aa  245  1e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  37.38 
 
 
423 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  38.08 
 
 
421 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  40.29 
 
 
402 aa  236  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  37.59 
 
 
421 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  34.71 
 
 
409 aa  223  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  36.27 
 
 
401 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  34.7 
 
 
403 aa  215  1e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  34.04 
 
 
413 aa  214  3e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  33.65 
 
 
420 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.47 
 
 
432 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.81 
 
 
413 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  34.36 
 
 
419 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  33.63 
 
 
426 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  35.42 
 
 
480 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  34.04 
 
 
419 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  35.37 
 
 
404 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.18 
 
 
413 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  33.95 
 
 
413 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  34.12 
 
 
436 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  35.07 
 
 
400 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  36.3 
 
 
391 aa  203  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.23 
 
 
416 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  35.03 
 
 
470 aa  202  1e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  33.49 
 
 
414 aa  199  1e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  35.06 
 
 
405 aa  199  1e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.39 
 
 
425 aa  198  1e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.16 
 
 
412 aa  196  5e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  34.68 
 
 
482 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  34.39 
 
 
413 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.7 
 
 
415 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  33.18 
 
 
486 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.81 
 
 
411 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  33.33 
 
 
405 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  35.6 
 
 
407 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  33.25 
 
 
417 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.25 
 
 
411 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.4 
 
 
413 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  33.41 
 
 
415 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  33.01 
 
 
403 aa  185  1e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.92 
 
 
408 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  34 
 
 
410 aa  182  8e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  31.94 
 
 
412 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.07 
 
 
409 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.07 
 
 
409 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.07 
 
 
409 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  32.46 
 
 
431 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 
443 aa  179  6e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  31.87 
 
 
448 aa  178  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  31.34 
 
 
412 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  31.83 
 
 
411 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  30.5 
 
 
436 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  33.66 
 
 
396 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  31.81 
 
 
411 aa  175  1e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  31.14 
 
 
478 aa  175  1e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>