More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0608 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 
409 aa  834    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  46 
 
 
419 aa  360  3e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  45.16 
 
 
404 aa  358  8e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  46.53 
 
 
412 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  44.17 
 
 
404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  44.67 
 
 
407 aa  353  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  44.09 
 
 
405 aa  353  4e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  45.04 
 
 
414 aa  341  1e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  43.89 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  44.89 
 
 
408 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  45.26 
 
 
414 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  45.15 
 
 
414 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  45.17 
 
 
414 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  44.78 
 
 
388 aa  322  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  42.68 
 
 
413 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  41.98 
 
 
409 aa  311  9e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  43 
 
 
408 aa  306  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  42.64 
 
 
404 aa  303  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  41.65 
 
 
412 aa  292  7e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  40.4 
 
 
407 aa  281  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  40.9 
 
 
415 aa  278  1e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  35.7 
 
 
408 aa  265  8e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  39.9 
 
 
389 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  38.29 
 
 
408 aa  253  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  37.09 
 
 
408 aa  249  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  39.81 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  36.25 
 
 
411 aa  242  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  38.44 
 
 
393 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  37.19 
 
 
393 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 
393 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  35.92 
 
 
408 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  37.62 
 
 
407 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  35.85 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  38.33 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  37.93 
 
 
394 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  36.45 
 
 
407 aa  231  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  36.52 
 
 
405 aa  229  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  37.93 
 
 
394 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  38.18 
 
 
394 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  37.93 
 
 
394 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  34.63 
 
 
398 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 
394 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 
394 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  34.54 
 
 
396 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  37.93 
 
 
394 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  37.23 
 
 
399 aa  226  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  37.65 
 
 
394 aa  226  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  36.61 
 
 
395 aa  225  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  35.28 
 
 
397 aa  225  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  37.44 
 
 
394 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  37.01 
 
 
394 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  35.29 
 
 
402 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  35.11 
 
 
400 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  37.23 
 
 
399 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  35.44 
 
 
398 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  37.19 
 
 
394 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  36.05 
 
 
395 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  37.44 
 
 
394 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  35.99 
 
 
398 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.92 
 
 
650 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.78 
 
 
655 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  35.9 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  37.41 
 
 
394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  36.54 
 
 
397 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  35.21 
 
 
397 aa  223  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  35.63 
 
 
393 aa  222  8e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  35.29 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  34.06 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  35.84 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  35.59 
 
 
395 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  36.06 
 
 
399 aa  221  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  35.21 
 
 
397 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  34.71 
 
 
398 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  36.98 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  35.42 
 
 
400 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  35.66 
 
 
400 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  35.59 
 
 
398 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  35.66 
 
 
388 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.06 
 
 
646 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  35.07 
 
 
398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  33.99 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  35.61 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  37.99 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  35.61 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  37.75 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  34.89 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  34.62 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  33.74 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  35.96 
 
 
393 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  34.62 
 
 
409 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  35.18 
 
 
398 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  35.17 
 
 
401 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  36.17 
 
 
395 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  35.19 
 
 
402 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  35.47 
 
 
396 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  34.53 
 
 
398 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  35.41 
 
 
402 aa  210  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 
392 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  35.44 
 
 
398 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>