More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2644 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 
363 aa  704  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  96.97 
 
 
370 aa  659  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  98.9 
 
 
363 aa  697  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  70.72 
 
 
347 aa  357  2e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.38 
 
 
320 aa  184  2e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.90012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.13 
 
 
320 aa  175  1e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54633e-15 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.85 
 
 
320 aa  172  6e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.93 
 
 
323 aa  163  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.45 
 
 
327 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.44 
 
 
330 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.88 
 
 
344 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88191e-06 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.2 
 
 
318 aa  154  3e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.59 
 
 
354 aa  149  1e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.99 
 
 
391 aa  147  2e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.07 
 
 
358 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  3.42072e-10 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.25 
 
 
335 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.24 
 
 
340 aa  145  7e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.32 
 
 
331 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.01 
 
 
383 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.84 
 
 
351 aa  141  1e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.81 
 
 
329 aa  141  2e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.88 
 
 
320 aa  140  4e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  31.86 
 
 
321 aa  140  5e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.00228e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.27 
 
 
332 aa  139  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39 
 
 
589 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  29.56 
 
 
339 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.99 
 
 
324 aa  135  1e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.8 
 
 
326 aa  135  1e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.48 
 
 
335 aa  135  1e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.65 
 
 
345 aa  134  2e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.33 
 
 
343 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1976  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.86 
 
 
650 aa  133  4e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0621035 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.33 
 
 
339 aa  132  7e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  27.79 
 
 
326 aa  132  8e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4903  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.24 
 
 
731 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742776  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  42.49 
 
 
298 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  35.5 
 
 
499 aa  130  4e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  28 
 
 
327 aa  130  4e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.71 
 
 
678 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  38.16 
 
 
365 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  27.71 
 
 
327 aa  129  7e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2350  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.71 
 
 
679 aa  129  7e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156854  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  27.71 
 
 
327 aa  129  7e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  35.93 
 
 
388 aa  129  8e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  27.71 
 
 
327 aa  129  1e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  31.06 
 
 
320 aa  129  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1919  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.18 
 
 
572 aa  127  2e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1591  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.18 
 
 
572 aa  127  2e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.382177  normal  0.054959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  27.43 
 
 
327 aa  128  2e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  27.71 
 
 
327 aa  127  2e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  27.43 
 
 
327 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  27.43 
 
 
327 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  37 
 
 
343 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  27.43 
 
 
327 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.05 
 
 
586 aa  127  4e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36 
 
 
588 aa  127  4e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.71 
 
 
701 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  27.43 
 
 
327 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.36 
 
 
614 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.44 
 
 
338 aa  125  8e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2534  DNA-directed DNA polymerase  36.19 
 
 
614 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.65 
 
 
558 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.66 
 
 
589 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.18 
 
 
930 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  28.69 
 
 
337 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  34.6 
 
 
537 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  1.00554e-07 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.84 
 
 
591 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.24 
 
 
561 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1670  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.24 
 
 
605 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.595012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.24 
 
 
737 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.21 
 
 
559 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.38 
 
 
485 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.09 
 
 
795 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.17 
 
 
517 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  41.38 
 
 
284 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  8.56784e-05 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2671  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.18 
 
 
556 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2330  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.76 
 
 
620 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  38.32 
 
 
690 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2802  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.18 
 
 
556 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.16 
 
 
553 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1457  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.68 
 
 
647 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.11 
 
 
606 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.52 
 
 
606 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.67 
 
 
610 aa  122  1e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.15 
 
 
582 aa  122  1e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.45747e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.48 
 
 
478 aa  122  1e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6089  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  31.85 
 
 
371 aa  121  1e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36 
 
 
914 aa  122  1e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.52 
 
 
601 aa  122  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.52 
 
 
601 aa  122  1e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36 
 
 
553 aa  122  1e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.55 
 
 
667 aa  121  2e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.77 
 
 
730 aa  121  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1191  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.09 
 
 
728 aa  121  2e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.775033  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.48 
 
 
478 aa  121  2e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1035  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.29 
 
 
731 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.430627  normal  0.544075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  33.6 
 
 
390 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1127  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.29 
 
 
733 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.54 
 
 
643 aa  120  4e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.54 
 
 
643 aa  120  4e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.4955e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>