552 genes were found for organism Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PHATR_10187  CDS  NC_011671  298152  298664  513  predicted protein  XP_002186037  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10196  CDS  NC_011671  1068238  1068510  273  predicted protein  XP_002186460  normal  0.609433  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10199  CDS  NC_011671  310168  310936  769  predicted protein  XP_002186321  normal  0.478324  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10209  CDS  NC_011671  456549  459374  2826  predicted protein  XP_002186065  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10213  CDS  NC_011671  288024  288569  546  predicted protein  XP_002186314  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10216  CDS  NC_011671  1323491  1323757  267  predicted protein  XP_002186231  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10239  CDS  NC_011671  894063  895262  1200  predicted protein  XP_002186430  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10247  CDS  NC_011671  316806  317561  756  predicted protein  XP_002186040  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10251  CDS  NC_011671  676983  678046  1064  predicted protein  XP_002186107  normal  0.0349969  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10257  CDS  NC_011671  1382085  1383509  1425  predicted protein  XP_002186243  normal  0.144929  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10260  CDS  NC_011671  907446  909191  1746  predicted protein  XP_002186435  normal  0.747034  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10261  CDS  NC_011671  1143808  1144257  450  predicted protein  XP_002186479  hitchhiker  0.00158824  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10271  CDS  NC_011671  126527  126772  246  predicted protein  XP_002186283  normal  0.804871  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10282  CDS  NC_011671  1390803  1392725  1923  predicted protein  XP_002186244  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10284  CDS  NC_011671  876952  882368  5417  predicted protein  XP_002186146  normal  0.61976  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10286  CDS  NC_011671  746987  747190  204  predicted protein  XP_002186408  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10291  CDS  NC_011671  447533  448498  966  predicted protein  XP_002186346  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10293  CDS  NC_011671  667689  668616  928  predicted protein  XP_002186106  normal  0.0891574  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10299  CDS  NC_011671  821939  822340  402  predicted protein  XP_002186136  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10306  CDS  NC_011671  147175  147978  804  predicted protein  XP_002186286  normal  0.275208  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10310  CDS  NC_011671  1323940  1324197  258  predicted protein  XP_002186505  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10319  CDS  NC_011671  401356  404568  3213  predicted protein  XP_002186338  normal  0.195718  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10350  CDS  NC_011671  353440  353946  507  predicted protein  XP_002186329  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10354  CDS  NC_011671  1151227  1153245  2019  predicted protein  XP_002186193  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10362  CDS  NC_011671  1160575  1161471  897  predicted protein  XP_002186481  normal  0.203022  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10363  CDS  NC_011671  929899  930048  150  predicted protein  XP_002186155  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10367  CDS  NC_011671  38488  40134  1647  predicted protein  XP_002186266  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10378  CDS  NC_011671  338502  340130  1629  predicted protein  XP_002186044  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10391  CDS  NC_011671  1372694  1373122  429  predicted protein  XP_002186240  normal  0.505046  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10398  CDS  NC_011671  1373457  1374181  725  predicted protein  XP_002186518  normal  0.296577  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10409  CDS  NC_011671  341362  342619  1258  predicted protein  XP_002186045  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10418  CDS  NC_011671  792698  793825  1128  predicted protein  XP_002186131  decreased coverage  0.00425999  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10437  CDS  NC_011671  70159  70584  426  predicted protein  XP_002186273  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10438  CDS  NC_011671  645554  647227  1674  PDS-like 1, phytoene desaturase-like protein, phytoene dehydrogenase-like protein  XP_002186389  normal  0.460239  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10454  CDS  NC_011671  640526  641422  897  predicted protein  XP_002186099  normal  0.680797  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10458  CDS  NC_011671  454193  454708  516  predicted protein  XP_002186348  normal  0.013689  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10479  CDS  NC_011671  1020957  1022213  1257  predicted protein  XP_002186170  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10494  CDS  NC_011671  1368585  1368881  297  predicted protein  XP_002186239  normal  0.774867  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10497  CDS  NC_011671  1023592  1024515  924  predicted protein  XP_002186171  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10499  CDS  NC_011671  424144  425136  993  predicted protein  XP_002186058  normal  0.181125  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10508  CDS  NC_011671  1052998  1053672  675  predicted protein  XP_002186176  normal  0.677045  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10518  CDS  NC_011671  1412345  1412722  378  predicted protein  XP_002186248  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10524  CDS  NC_011671  12974  13821  848  predicted protein  XP_002185982  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10531  CDS  NC_011671  934624  937388  2765  predicted protein  XP_002186437  normal  0.192745  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10532  CDS  NC_011671  1427676  1428271  596  predicted protein  XP_002186251  normal  0.84524  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10539  CDS  NC_011671  901452  902435  984  predicted protein  XP_002186433  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10544  CDS  NC_011671  204927  206417  1491  predicted protein  XP_002186299  normal  0.0977616  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10546  CDS  NC_011671  1209871  1210815  945  predicted protein  XP_002186202  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10566  CDS  NC_011671  1235317  1235598  282  predicted protein  XP_002186494  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10567  CDS  NC_011671  524271  525182  912  predicted protein  XP_002186365  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10571  CDS  NC_011671  697058  697648  591  predicted protein  XP_002186112  normal  0.0354297  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10581  CDS  NC_011671  905718  907319  1602  predicted protein  XP_002186434  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10583  CDS  NC_011671  652111  652486  376  predicted protein  XP_002186102  normal  0.329173  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10585  CDS  NC_011671  1338800  1340140  1341  predicted protein  XP_002186234  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10593  CDS  NC_011671  203245  203844  600  predicted protein  XP_002186298  normal  0.557701  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10595  CDS  NC_011671  1231302  1231877  576  predicted protein  XP_002186492  normal  0.138069  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10617  CDS  NC_011671  252745  253431  687  predicted protein  XP_002186307  normal  0.290577  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10628  CDS  NC_011671  605563  607759  2197  predicted protein  XP_002186091  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10640  CDS  NC_011671  1340236  1341114  879  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  XP_002186510  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10655  CDS  NC_011671  1000197  1000968  772  predicted protein  XP_002186443  normal  0.451617  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_10659  CDS  NC_011671  312512  313723  1212  predicted protein  XP_002186322  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_1379  CDS  NC_011671  679462  680511  1050  predicted protein  XP_002186395  normal  0.815814  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_1389  CDS  NC_011671  688166  689239  1074  predicted protein  XP_002186109  hitchhiker  3.37906e-07  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_1494  CDS  NC_011671  874173  875645  1473  predicted protein  XP_002186426  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_1534  CDS  NC_011671  1449312  1450844  1533  predicted protein  XP_002186254  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_1764  CDS  NC_011671  85847  87211  1365  predicted protein  XP_002186276  normal  0.289242  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18458  CDS  NC_011671  181367  182843  1477  predicted protein  XP_002186294  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18469  CDS  NC_011671  209917  211915  1999  predicted protein  XP_002186017  normal  0.0427076  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18473  CDS  NC_011671  217885  220232  2348  predicted protein  XP_002186302  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18475  CDS  NC_011671  223682  225603  1922  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  XP_002186303  decreased coverage  0.00280729  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18481  CDS  NC_011671  229447  230200  754  predicted protein  XP_002186021  normal  0.228231  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18489  CDS  NC_011671  264327  265442  1116  predicted protein  XP_002186029  normal  0.0358222  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18516  CDS  NC_011671  400400  401239  840  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit  XP_002186053  normal  0.0149208  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18524  CDS  NC_011671  413705  417174  3470  predicted protein  XP_002186340  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18533  CDS  NC_011671  451286  452245  960  predicted protein  XP_002186347  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18549  CDS  NC_011671  504413  509119  4707  predicted protein  XP_002186361  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18551  CDS  NC_011671  514714  516538  1825  predicted protein  XP_002186362  normal  0.507401  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18559  CDS  NC_011671  561782  562894  1113  predicted protein  XP_002186083  normal  0.0884469  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18572  CDS  NC_011671  598333  600997  2665  catalase-peroxidase  XP_002186090  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18579  CDS  NC_011671  617949  619672  1724  predicted protein  XP_002186383  normal  0.445158  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18585  CDS  NC_011671  626268  626826  559  predicted protein  XP_002186386  normal  0.206689  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18599  CDS  NC_011671  658083  658901  819  predicted protein  XP_002186391  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18620  CDS  NC_011671  707278  708245  968  predicted protein  XP_002186114  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18622  CDS  NC_011671  708929  711850  2922  predicted protein  XP_002186401  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18665  CDS  NC_011671  884561  886280  1720  serine hydroxymethyltransferase  XP_002186147  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18693  CDS  NC_011671  995612  1000106  4495  predicted protein  XP_002186167  normal  0.749806  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18735  CDS  NC_011671  1148774  1150129  1356  predicted protein  XP_002186192  normal  0.609957  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18745  CDS  NC_011671  1162188  1164181  1994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  XP_002186195  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_1875  CDS  NC_011671  412189  413247  1059  predicted protein  XP_002186056  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18769  CDS  NC_011671  1229975  1230921  947  predicted protein  XP_002186209  normal  0.032519  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18793  CDS  NC_011671  1331148  1333723  2576  predicted protein  XP_002186508  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18808  CDS  NC_011671  1343896  1344535  640  predicted protein  XP_002186511  normal  0.808582  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_18826  CDS  NC_011671  1401276  1404967  3692  predicted protein  XP_002186524  normal  0.0391599  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_2432  CDS  NC_011671  839675  840589  915  predicted protein  XP_002186140  normal  0.790487  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_25572  CDS  NC_011671  159174  160802  1629  predicted protein  XP_002186008  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_25577  CDS  NC_011671  169520  170048  529  predicted protein  XP_002186290  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_25581  CDS  NC_011671  174398  175292  895  predicted protein  XP_002186292  normal  0.76196  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_25619  CDS  NC_011671  269640  270955  1316  predicted protein  XP_002186030  normal  0.290377  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_25666  CDS  NC_011671  466862  469929  3068  predicted protein  XP_002186352  normal  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
PHATR_25714  CDS  NC_011671  627022  627914  893  predicted protein  XP_002186096  normal  0.329815  n/a    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>