34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10479 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  100 
 
 		 300 aa  628  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  37.44 
 
 		 644 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  34.96 
 
 		 230 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  32.99 
 
 		 845 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  31.42 
 
 		 1053 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  34.23 
 
 		 1051 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  31.44 
 
 		 641 aa  123  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  38.2 
 
 		 883 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  33.91 
 
 		 872 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  29.17 
 
 		 658 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.653403 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  31.94 
 
 		 1120 aa  112  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  29.03 
 
 		 938 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.500519 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  32.55 
 
 		 1076 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  27.46 
 
 		 647 aa  95.9  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  30.7 
 
 		 1137 aa  93.2  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  29.22 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  31.91 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82544  predicted protein  27.16 
 
 		 558 aa  75.5  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  31.94 
 
 		 824 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  28.92 
 
 		 940 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0509505 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03752  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04580)  26.26 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  28.14 
 
 		 897 aa  62.8  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  23.66 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31816  predicted protein  26.54 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0623295  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  24.04 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  21.18 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  25.15 
 
 		 774 aa  52.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.323048 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  27.54 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  24.29 
 
 		 817 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05780  hypothetical protein  20.85 
 
 		 657 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0217521  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  22.94 
 
 		 523 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  23 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_25081  predicted protein  22.76 
 
 		 802 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.315559 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00281  mitotic check point protein (Bub2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02940)  25.95 
 
 		 453 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558287  normal  0.0195499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>