25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04290 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  100 
 
 		 647 aa  1341    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  38.63 
 
 		 824 aa  197  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 		 644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  33.93 
 
 		 883 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  27.46 
 
 		 300 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  27.5 
 
 		 872 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 1051 aa  91.3  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  25.1 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  24.06 
 
 		 1120 aa  80.5  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  25.87 
 
 		 1137 aa  76.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  25.28 
 
 		 845 aa  73.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  26.02 
 
 		 1076 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  24.06 
 
 		 938 aa  67.8  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  26.25 
 
 		 1053 aa  67.4  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  26.09 
 
 		 230 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  23.92 
 
 		 658 aa  65.1  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.653403 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  22.5 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  29.3 
 
 		 940 aa  51.2  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  23.19 
 
 		 598 aa  50.8  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  22.28 
 
 		 440 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02160  conserved hypothetical protein  23.24 
 
 		 860 aa  47.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  22.48 
 
 		 137 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05780  hypothetical protein  23.28 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0217521  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  21.97 
 
 		 523 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  19.23 
 
 		 774 aa  44.3  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.323048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>