37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01110 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1051 aa  2136    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  31.61 
 
 
1076 aa  282  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  38.91 
 
 
1120 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  39.92 
 
 
938 aa  178  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  39.25 
 
 
1053 aa  160  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  38.16 
 
 
230 aa  153  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
644 aa  145  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  32.73 
 
 
845 aa  143  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  30 
 
 
674 aa  141  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  32.05 
 
 
872 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  33.73 
 
 
658 aa  132  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.653403 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  34.23 
 
 
300 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  32.86 
 
 
940 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  28 
 
 
641 aa  108  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  32.69 
 
 
1137 aa  104  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  34.13 
 
 
440 aa  101  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03752  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04580)  27.03 
 
 
741 aa  95.1  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  26.37 
 
 
647 aa  90.9  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05780  hypothetical protein  25.22 
 
 
657 aa  88.2  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0217521  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  27.78 
 
 
883 aa  85.9  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  33.17 
 
 
824 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  25.77 
 
 
774 aa  68.6  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.323048 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  24.88 
 
 
817 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  23.57 
 
 
897 aa  62.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82544  predicted protein  26.05 
 
 
558 aa  62  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_25081  predicted protein  26.14 
 
 
802 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.315559 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  27.14 
 
 
423 aa  55.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  23.24 
 
 
598 aa  55.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31816  predicted protein  26.07 
 
 
554 aa  54.7  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0623295  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  33.79 
 
 
137 aa  55.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  24.85 
 
 
333 aa  52  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  26.26 
 
 
318 aa  52  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  28.72 
 
 
684 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00281  mitotic check point protein (Bub2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02940)  24.19 
 
 
453 aa  48.5  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558287  normal  0.0195499 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00740  mitotic check point protein bub2, putative  26.61 
 
 
286 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  21.71 
 
 
523 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  23.67 
 
 
507 aa  45.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>