28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00620 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  100 
 
 		 1137 aa  2305    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 		 1051 aa  105  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 		 644 aa  103  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  32.18 
 
 		 1076 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  29.46 
 
 		 1120 aa  96.3  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  29.2 
 
 		 1053 aa  96.3  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  28.81 
 
 		 938 aa  95.5  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  30.7 
 
 		 300 aa  93.2  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  26.46 
 
 		 872 aa  88.6  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0970928 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  27.09 
 
 		 845 aa  86.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  30.63 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  25.63 
 
 		 647 aa  77  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  25.1 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  23.89 
 
 		 641 aa  66.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  25.48 
 
 		 658 aa  66.2  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.653403 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05780  hypothetical protein  26.02 
 
 		 657 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0217521  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  28.86 
 
 		 883 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  29.59 
 
 		 824 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  27.61 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  25.62 
 
 		 774 aa  55.1  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.323048 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  25.31 
 
 		 897 aa  55.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_25081  predicted protein  25.15 
 
 		 802 aa  54.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.315559 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03752  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04580)  24.58 
 
 		 741 aa  52  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  20.92 
 
 		 817 aa  52  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  27.4 
 
 		 940 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  28.15 
 
 		 137 aa  47.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  23.96 
 
 		 523 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31816  predicted protein  28.39 
 
 		 554 aa  44.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0623295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>