27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86304 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  39.24 
 
 
1120 aa  696    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  100 
 
 
938 aa  1934    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  40.73 
 
 
1053 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  39.92 
 
 
1051 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  33.78 
 
 
230 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
644 aa  130  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  27.97 
 
 
845 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  28.98 
 
 
658 aa  120  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.653403 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  28.62 
 
 
1076 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  29.03 
 
 
300 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  33.18 
 
 
872 aa  105  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  33.33 
 
 
940 aa  101  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  28.81 
 
 
1137 aa  97.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  28.7 
 
 
641 aa  95.5  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  28.85 
 
 
883 aa  79.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  24.33 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  25.19 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  29.2 
 
 
137 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82544  predicted protein  25.64 
 
 
558 aa  66.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  23.11 
 
 
674 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_25081  predicted protein  25 
 
 
802 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.315559 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03752  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04580)  26.47 
 
 
741 aa  51.6  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05780  hypothetical protein  25.58 
 
 
657 aa  49.3  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0217521  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31816  predicted protein  34.12 
 
 
554 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0623295  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00281  mitotic check point protein (Bub2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02940)  24.44 
 
 
453 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558287  normal  0.0195499 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  20.08 
 
 
598 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  23.67 
 
 
817 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>