22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30439 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  100 
 
 
940 aa  1912    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 
1051 aa  111  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  33.33 
 
 
938 aa  100  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.500519 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  34.88 
 
 
1076 aa  98.2  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  29.73 
 
 
1053 aa  96.3  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  30.14 
 
 
1120 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.988868 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  29.78 
 
 
845 aa  88.6  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  29.94 
 
 
674 aa  80.5  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  31.46 
 
 
658 aa  79.7  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.653403 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  29.17 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  29.41 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  28.92 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  25.79 
 
 
872 aa  68.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0970928 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  25.32 
 
 
883 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 
644 aa  62.4  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  26.14 
 
 
641 aa  53.5  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  29.3 
 
 
647 aa  51.6  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  27.4 
 
 
1137 aa  50.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  23.95 
 
 
897 aa  49.7  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  22.09 
 
 
774 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.323048 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  28.3 
 
 
423 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  24 
 
 
598 aa  44.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>