23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84608 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  100 
 
 		 774 aa  1590    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.323048 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  42.56 
 
 		 817 aa  570  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  33.38 
 
 		 897 aa  326  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  26.42 
 
 		 423 aa  87.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 1051 aa  69.7  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  22.82 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  22.76 
 
 		 523 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  28.57 
 
 		 230 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  21.92 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  25.76 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  27.54 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  20.75 
 
 		 872 aa  58.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  25.62 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  24.32 
 
 		 883 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  25.15 
 
 		 300 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  20.51 
 
 		 644 aa  52.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  27.22 
 
 		 684 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12157  predicted protein  23 
 
 		 330 aa  50.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  23.67 
 
 		 641 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  22.22 
 
 		 1076 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  22.09 
 
 		 940 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0509505 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00281  mitotic check point protein (Bub2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02940)  23.94 
 
 		 453 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558287  normal  0.0195499 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  19.23 
 
 		 647 aa  44.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>