28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00320 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  100 
 
 		 897 aa  1831    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  33.63 
 
 		 774 aa  329  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.323048 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  33.28 
 
 		 817 aa  322  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  23.94 
 
 		 507 aa  89.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  23.27 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  23.03 
 
 		 598 aa  81.6  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  26.43 
 
 		 883 aa  69.7  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  30 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  27.49 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  25.88 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  21.66 
 
 		 1051 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  28.14 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  28 
 
 		 1076 aa  61.2  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  20.52 
 
 		 647 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  24.03 
 
 		 872 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  25.41 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  27.07 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  20.89 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  24.22 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12157  predicted protein  25.17 
 
 		 330 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  29.09 
 
 		 137 aa  54.7  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  26.67 
 
 		 440 aa  51.6  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  25.34 
 
 		 230 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  23.95 
 
 		 940 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02160  conserved hypothetical protein  20.17 
 
 		 860 aa  48.5  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  20.62 
 
 		 845 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  23.93 
 
 		 1120 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41673  predicted protein  25 
 
 		 320 aa  44.3  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.455975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>