29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28778 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  100 
 
 
318 aa  653    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  35.09 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  23.75 
 
 
507 aa  96.7  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  24.35 
 
 
598 aa  96.3  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02160  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 
860 aa  95.9  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  28.02 
 
 
523 aa  92.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  28.15 
 
 
684 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  25.74 
 
 
817 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  27.7 
 
 
423 aa  79.3  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12157  predicted protein  22.88 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  26.32 
 
 
897 aa  69.3  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  28.07 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  23.9 
 
 
641 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90139  predicted protein  24.26 
 
 
510 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  25.76 
 
 
774 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.323048 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  26.04 
 
 
674 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00740  mitotic check point protein bub2, putative  27.84 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 
1051 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  23 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  22.66 
 
 
644 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02790  expressed protein  32.65 
 
 
393 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  22.84 
 
 
1076 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  24.46 
 
 
440 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  25.23 
 
 
940 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  26.03 
 
 
137 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03750  conserved hypothetical protein  22.36 
 
 
742 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55114  predicted protein  23.32 
 
 
617 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.950731  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  25.56 
 
 
824 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30730  predicted protein  26.67 
 
 
420 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>