17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02160 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK02160  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 860 aa  1762    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  34.52 
 
 		 684 aa  174  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  26.74 
 
 		 333 aa  90.1  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  23.62 
 
 		 598 aa  82.8  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90139  predicted protein  23.68 
 
 		 510 aa  73.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30730  predicted protein  24.65 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  25.36 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  22.86 
 
 		 507 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55114  predicted protein  23.58 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.950731  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  33.33 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00740  mitotic check point protein bub2, putative  35.79 
 
 		 286 aa  52  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12157  predicted protein  24.81 
 
 		 330 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  23.24 
 
 		 647 aa  48.1  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  19.75 
 
 		 897 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  31.75 
 
 		 883 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  19.83 
 
 		 644 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  23.56 
 
 		 872 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0970928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>